Nakon ponovnog ujedinjenja s Gwen Stacy, Brooklynov prijateljski nastrojeni Spider-Man iz susjedstva katapultira se preko Multiverzuma, gdje susreće tim Spider-ljudi zaduženih za zaštitu njegovog postojanja. Ali kada se heroji sukobe oko toga kako se nositi s novom prijetnjom, Miles se nađe suprotstavljen drugim Spiderima i mora redefinirati što znači biti heroj kako bi mogao spasiti ljude koje najviše voli.
Kad lijepu Buttercup otmu i zadrže protiv njezine volje kako bi se udala za odvratnog princa Humperdincka, Westley (njezin ljubavnik iz djetinjstva, sada vraćen kao Strašni pirat Roberts) pokušava je spasiti.
Amnezija je spasila posada talijanskog ribarskog broda kad pluta na moru. Nema identitet i prošlost, ali posjeduje niz izvanrednih talenata u lingvističkim, borilačkim i samoobrambenim umijećima koji sugeriraju profesiju rizika. Zbunjen i dezorijentiran, on poduzima besnu potragu da otkrije tko je i zašto je njegov život preuzeo tako opasan zaokret.
Nakon što je izgubio pamćenje i jedinu osobu koju je volio, Bourne je prisiljen razotkriti svoju prošlost kako bi mogao imati budućnost. Putujući od Moskve, Pariza, Londona do Tangera i New Yorka, nastavlja potragu za pravim Jasonom Bourneom – cijelo vrijeme nastojeći nadmudriti brojne policajce, savezne časnike i Interpolove agente koji ga drže na nišanu.
Prošlost Jason Bournea vraća se po njega. U drugom dijelu sage o tri filma koja se temelji na životu Jason Bournea, bivšeg CIA-inog agenta koji gubi pamćenje i dok se bori da ga oporavi i otkrije tko je on, našao se uključen u mrežu špijunaže i vladine manipulacije od strane Sjedinjenih Država gdje će ga progoniti profesionalni ubojice, paravojni plaćenici i bivši CIA-ini drugovi. Film započinje u Goi u Indiji, gdje su Jason i Marie otišli živjeti da bi se sakrili od Treadstonea, ali tamo ima bivšu tvrtku agent ih locira i progoni. Jason Bourne započinje svoju avanturu da otkrije svoju prošlost sjećanjem se dijela toga i progoni agenta koji se također predstavlja kao on.
Opsjednuti znanstvenik provodi nečasne pokuse u evoluciji, da bi se na kraju postavio kao samozvani polubog u rasi mutiranih, polu-ljudskih gadosti.