Pienen kaupungin lukion opettajat alkavat käyttäytyä tavallistakin oudommin. He ovat suorastaan kuin vieraalta planeetalta. Pari oppilasta sattuu näkemään kuinka koulun terveydenhoitaja tapetaan. Mutta hän ei kuole. Pian lähes kaikki koulun oppilaatkin ovat todella omituisia. Mitä on tekeillä? Mikä ihme ottaa vallan ihmisistä? Vain kourallinen oppilaita osaa epäillä jotain outoa olevan tekeillä. Jotain todella outoa...
Kalifornialaisen pikkukaupungin asukkaat joutuvat kuolemanvaarallisten hämähäkkien hyökkäysten kohteiksi, ja kahden lääkärin on keksittävä keino päästäkseen eroon kahdeksanjalkaisista tappajista, ennen kuin ne valtaavat koko kaupungin.
Kelly ja Jim ovat pariskunta, joka on lähtenyt metsään kameran kanssa dokumentoidakseen mitä tapahtui legendalle nimeltä Bigfoot. Jim on fanaattisen kiinnostunut, kun taas Kelly on mukana enimmäkseen vain tukeakseen miestään. Mutta mitä enemmän he tutkivat salaperäistä katoamistapausta, sitä enemmän he ovat pahoillaan, että ovat lähteneet ulos yksin pimeässä kolkkoon metsään.
Edellisestä osasta Sharknado 1 tuttu Fin Shepard ja hänen ex-vaimonsa April Wexler ovat matkalla New Yorkiin markkinoimaan Aprilin kirjoittamaa kirjaa How to Survive a Sharknado and Other Unnatural Disasters. Heidän ollessaan lentokoneessa keskellä myrskyä konetta päin alkaa yllättäen lennellä haita. Lopulta koneen moottori hajoaa ja useita ihmisiä kuolee. April loukkaantuu pahasti, mutta Fin onnistuu saamaan koneen laskeutumaan lentokentälle.