יצירת מופת מאויירת להפליא ועמוסה בקטעי פעולה שכתב מאמורו אושיי (Ghost in the Shell, Avalon) וביים הירויוקי הוקייורה (אנימטור בכיר ב- Akira). יפן של שנות ה-50, האלימות גוברת ברחוב ובמשטרה. לוחם יחידה מובחרת לא מצליח למנוע פיגוע התאבדות של מחבלת, ומאחר שפניה נותרים חקוקים במוחו הוא יוצא למסע חיפושים אחר דמותה. כשהוא פוגש את אחותה הם נקלעים למאבק שמתחולל בין הטרור הבלתי מתפשר לבין יחידות המשטרה האלימות.
ביער מכוסה קרח ושלג, יער אלאור הוא ביתם של חיות קסומות מסוכנות ו-50 אלפים קפואים בכלא מקרח.. יום אחד, הרוח הגדולה פק עוזרת לנערה צעירה לצאת מכלא הקרח שלה. שמה אמיליה, חצי אלף שנולדה עם שיער כסוף, אוזניים ארוכות ועיניים סגלגלות אותו התיאור העונה לשם "המכשפה של הקנאה" אותה המכשפה שהחריבה חצי עולם לפני זמן רב. מודחקת מהחברה בגלל המראה שלה… אמיליה נדחקת ליער ביחד עם פק הרוח הנודדת כחבר היחידי שיארח לה חברה. מתמודדת עם חטא של הרסנות שהיא אינה זוכרת שביצעה, היא מקדישה את חיה למטרה לשחרר את כל קרוביה הכלואים בכלא הקרח. אבל כשהרוח הגדולה מלאקוווארה המשגיח של העולם מבחין בקיומה, הזכות של אמיליה להישאר בחיים מוטלת בספק. האם אותם קשרים מקרח שיצרה ביער יעזרו לה להתגבר על אותו גורל?
קימטסו נו יאיבה: אל כפר נפחי החרב לראשונה על מסך הקולנוע יוצגו פרקים 10 ו-11 של 'Entertainment District Arc' (ארק מחוז השעשועים), שבהם מתרחש הקרב העז בין טנג'ירו, טנגן אוזוי (האשירת הצליל) וחבריהם לבין דאקי וגיוטארו, העליונים השישיים. בנוסף, מוצג הפרק הראשון של 'Swordsmith Village Arc' (ארק כפר נפחי החרבות), שבו נכיר את מויצ'ירו טוקיטו, האשירת הערפל, את מיצורי קנרוג'י, האשירת האהבה ואת השדים העליונים שהוזמנו בכללותם אל טירת הנצח.
אספן פוקימונים רשע בשם" לורנס השלישי" יוצא אל איי התפוז ללכוד את שלושת הפוקימונים מולטרס, זאפדוס וארטיקנו כדי למשוך מהים את הפוקימון השומר, לוגיה. מעשה זה גורם לשרשרת אסונות טבע בכל העולם, מה שלא מזיז לאספן. אש, מיסטי וברוק מגיעים לאיי התפוז והמקומיים מבקשים מאש להשתתף בפסטיבל האגדות הפולחני שלהם. על אש לאסוף שלושה כדורי זכוכית ממקומות שונים. אם יצליח, יוכל לסכל את מזימתו של לורנס, לרכוב על לוגיה ולהציל את העולם.
סטלה בת ה-5 ואחיה בן ה-13 פליי מגיעים לבלות אחר הצהריים עם דודתם אנה ובנה, פריק מחשבים שמן מאוד בשם צ'אק. לשלושה נמאס מחברת דודתם המשעממת, והם יוצאים לדוג, אבל כשמגיעה הגאות הם אינם מוצאים את דרכם הביתה. הם מגיעים למעבדתו של מדען מטורף הבטוח שהתחממות כדור הארץ עומדת להמיס את הקטבים בכל רגע. המדען הכין לקראת המאורע, שיקוי מיוחד ההופך בני אדם לדגים, בכדי שהם יוכלו לשרוד בעולם החדש שבפתח. אחרי שסטלה טועמת בטעות מן השיקוי, הופכת לדג ויוצאת לאוקיאנוס, פליי וצ'אק שותים גם הם מהשיקוי ויוצאים אחריה עם שיקוי נגדי על מנת להציל אותה. בדרכם הם פוגשים את ג'ו, דג חם מזג, בעל אשליות גדלות. כשג'ו טועם מן השיקוי הנגדי הוא מתחיל לפתח אינטליגנציה וחשיבה אנושית ומפתח תוכנית על להשתלטות על האוקיאנוסים.
העלילה הפעם מתמקדת בפוקימון האגדי סלבי, שתפקידו הוא להיות השומר של היער בארבוויל. פוקימון זה ידוע בכוחותיו המופלאים אשר מאפשרים לו לעבור בזמן ובדיוק מסיבה זו צייד פוקימונים מנסה לתפוס את הפוקימון האגדי. רגע לפני התפיסה המיוחלת, נער צעיר בשם סם אוק (פרופסור סמואל אוק לימים) נחלץ לעזרתו של סלבי ויחד הם נמלטים ועוברים 40 שנה קדימה בזמן. אחרי המעבר בזמן סם פוגש את אש קאטשם הצעיר ואת שאר החבורה. במהלך הסרט הם מגלים שגם בעתיד ישנה סכנה קיומית לסלבי וזאת מכיוון שחבר צוות רוקט מנסה לתפוס אותו בשאיפה לשלוט על העולם. אש וסם אז מחליטים להציל את המצב ומגלים שיעור בחברות שתהדהד מעל ומעבר למבחן הזמן.