On olemas kaks reaalsust: see, milles me päevast päeva elame, ja teine, mis asub selle taga. Neo otsib tõde Matrixi kohta, millest ta on kuulnud vaid arglikke sosinaid ja kuulujutte. See on midagi salapärast ja ohtlikku ning Neo on kindel, et see kontrollib kõigi inimeste elusid. Ta usub, et Morpheus, keda peetakse kõige ohtlikumaks meheks maailmas, on just see, kes suudaks anda vastuse küsimusele: mis on Matrix?

Constantine (Keanu Reeves) on käinud sõna otseses mõttes põrgus ja sealt elusalt tagasi tulnud. Ta peab koos politseinik Angelaga (Rachel Weisz) jõud ühendama, et uurida Angela kaksikõdede enesetappu. See uurimine viib neid deemonite maailma, mis asub otse Los Angelese all.