تدور قصة الانمي في عام 2027 في مدينة كيوتو ومعالم مشهورة من المدينة إضافة إلى عوالم موازية وسفر عبر الزمن في قصة حب يقف في طريقها الكثير

عاد الوكلاء J و K ... في الوقت المناسب. لقد رأى J بعض الأشياء التي لا يمكن تفسيرها خلال 15 عامًا مع Men in Black ، لكن لا شيء ، ولا حتى الفضائيين ، يحيره بقدر ما يحير شريكه الساخر والمتحفظ. ولكن عندما تتعرض حياة K ومصير الكوكب للخطر ، سيتعين على العميل J العودة في الوقت المناسب لوضع الأمور في نصابها الصحيح. يكتشف J أن هناك أسرارًا للكون لم يخبره بها K أبدًا - أسرار ستكشف عن نفسها عندما يتعاون مع العميل K الشاب لإنقاذ شريكه والوكالة ومستقبل البشرية.