„Порекло очију“ приповеда причу о др Ијану Греју (Мајкл Пит), молекуларном биологу који изучава развој ока. Након кратког сусрета са необичном девојком (Астрид Берже-Фризби), која нестаје без поздрава, он схвата да посао превише утиче на његов живот. Наставља своје истраживања и годинама касније, заједно са својом лабораторијском партнерком Карен (Брит Марлинг) долази до невероватног научног открића које има дубљи смисао и које компликује његова дотадашња научна и духовна убеђења. Путујући широм света, ризикује све што је икад знао да би доказао своју теорију.
Адам је младић који живи са девојком Рејчел, која се уопште не свиђа његовом најбољем другу и сараднику, Кајлу. Адам се жали Кајлу на његов лош сексуални живот, што је још један разлог за Кајла да стекне негативно мишљење о Рејчел. Адам има проблем са леђима и решио је да се обрати лекару. Нажалост, доктор му је након прегледа саопштио лошу вест, да има ретку врсту канцера и да ће морати да крене на хемотерапију како би смањио тумор. Такође му је дао број медицинског особља које разговора са људима који су болесни у покушају да им смањи стрес и усади неку врсту мира. Након тужног сазнања Адам је вест прво саопштио Рејчел и рекао јој да ако жели да оде, да иде, да му неће сметати. Међутим, она је одлучила да остане уз њега, због чега је њему било веома драго. Потом је обавестио и родитеље. Мајка му је била у шоку. Хтела је да преузме одговорност на себе и она да се брине о њему, али Адам је то одбио, пошто му мајка има већ довољно брига око његовог оца, који има Алцхајмерову болест.
Марина је млада конобарица и будућа певачица. Орландо има своју штампарију. Заједно планирају будућност. Међутим, Орландо изненада умре, и Марина остаје потпуно сама, али и под притисцима и оптужбама Орландове породице, али и полиције која почиње да истражује њену евентуалну умешаност у Орландову смрт. Са друге стране, Орландова бивша жена јој забрањује да присуствује сахрани, док је Орландов син избацује из стана. Имајући у виду да је Марина трансродна жена, за већи део Орландове породице њен сексуални идентитет је срамотан и ненормалан. Марина тада одлучује да се супротстави његовој породици и друштву и покаже им ко је она заправо – сложена, снажна, искрена и... фантастична жена.