Tulevaisuuden New Yorkista on kasvanut 40 miljoonan asukkaan ylikansoitettu jättiläiskaupunki, lihasta ja vihanneksista ei tietoakaan. Kupungissa terrorismi ja väkivalta on saanut yliotteen ja se alkaa hitaasti tukehtua. Ainoaa ravintoa mikä on jäljellä valmistaa suuryhtiö Soylent Company. Yhtiö päättää yksinvaltiaan tavoin New Yorkin elämästä ja tulevaisuudesta. Yksi yhtiön korkeimmista johtajista löydetään eräänä iltana murhattuna kotoaan. Rikosetsivä Thorn määrätään tutkimaan tapausta. Murhatutkimus johtaa vähän kerrallaan yhteiskunnallisen mysteerin jäljille, jota etsivä itsepäisesti jäljittää. Mitä kaikkea murhan takana oikein on?
Kun 9 (Elijah Wood) syntyy, hän huomaa olevansa maailmanlopun jälkeisessä maailmassa. Ihmisiä ei enää ole, ja ainoastaan hyvän tuurin ansiosta hän löytää pienen ryhmän muita hänen kaltaisiaan jotka pakenevat henkensä kaupalla pelottavia koneita, jotka hallitsevat maailmaa. Vaikka 9 on tämän joukon untuvikko, niin hän saa muut vakuuttauneeksi siitä, että pakoilu ei kannata. Heidän täytyy ryhtyä hyökkäykseen selvitäkseen hengissä ja samalla selvittää, miksi koneet haluavat tuhota heidät. Pian he huomavat, että itse elämän säilyminen saattaa olla heidän käsissään...
Lähitulevaisuudessa tekoäly hallitsee kaikkien elämää, ja ihmisen tunteet koetaan uhkana.