Jätkub eepiline “Ristiisa” triloogia Corleonede perekonna võimuvõitlusest läbi kahe põlvkonna. Teises osas põimuvad kaks lugu, mis kajastavad nii esimesele filmile eelnevaid kui ka järgnevaid sündmusi. Üks kujutab Sitsiiliast pärit don Vito tõusu New Yorgi maffiaperekonna peaks. Teine osa keskendub sellele, kuidas Vito poeg, Michael, perekonna äri 50nendatel juhib ning lisaks Las Vegases ja Kuubas kanda üritab kinnitada.
Mathilda (Natalie Portman) on noor, 13. aastane, tüdruk. Kartmatu tüdruku elu muutub aga kardinaalselt kui ta vanemad, õde ning vend tapetakse. Ise mõrtsukate eest põgenedes leiab ta varjupaika teise profesionaalse palgamõrtsuka, Leoni (Jean Reno) juures. Leon tegutseb üksi, osavalt, haudvaikselt ning märkamatult - ta ei jää kunagi vahele ning üksi elades ei saa keegi ka ta lähedaste kaudu teda kätte, isegi mitte tema vaenlased. Leon tahab Mathildast kiiresti vabaneda, kuid tüdruk leiab temas üles hellad kohad ning suudab ta ümber veenda. Lisaks palub ta Leoni, et too õpetaks talle mõrtsuka töövõtteid, et ta saaks isiklikult enda pere mõrvamise eest kätte maksta.
“Ristiisa” triloogia kolmanda ehk viimase osa tegevus toimub 1979. aastal. Soovides lunastada minevikupatte, püüab kuuekümnendates aastates maffiapealik Michael kuritegelikust maailmast tagasi tõmbuda ning oma äritegevust legaliseerida. Paraku tuleb silmitsi seista noore ja ambitsioonika gangsteri sepistustega, kelle ainukeseks sooviks on maffiapealiku plaanid nurjata.