Doi escroci spanioli câștigă o hartă cu drumul către legendarul oraș al aurului, dar după ce ajung în El Dorado, lucrurile nu mai merg conform planului.

În 1914, un tânăr lingvist pe nume Milo Thatch (Michael J. Fox) visează să găsească miticul oraș Atlantis, urmând moștenirea bunicului său. Ocazia lui vine când un excentric milionar îi finanțează o expediție submarină alături de o echipă de aventurieri. Cu toate acestea, nu totul va fi ușor, deoarece se vor confrunta cu obstacole periculoase, trădări și secrete ascunse. Milo va trebui să-și dovedească curajul și inteligența pentru a descoperi misterele Atlantisului și a proteja locuitorii săi.

Alex, Marty, Melman, Gloria, regele Julien, Maurice, pinguinii și maimuțele s-au întors și sunt încă naufragiați în Madagascar. În fața acestui obstacol New yorkezii au născocit un plan atât de nebunesc încât s-ar putea să meargă. Cu precizie militară, pinguinii au reparat un avion vechi prăbușit, oarecum