Există două lumi: prima, cea în care trăim zi de zi, și cea de-a doua, deloc cunoscută, paralelă cu cea reală. Una este vis. Cealaltă este Matricea. Neo încearcă din răsputeri să afle adevărul despre acea lume despre care a auzit vorbindu-se doar în șoaptă, lume misterioasă și plină de necunoscut. Dar ce este Matricea? Neo crede că Morpheus, o persoană pe care o cunoaşte doar din povești, un tip pe care nu-l prinzi niciodată, considerat în acelaşi timp cel mai periculos bărbat în viață, poate să-i dea acest răspuns. Dar adevărul pe care Neo îl află este mult peste așteptări. Iar viața lui nu va mai fi la fel.
Echipa trebuie să apere orașul Sion, ultimul bastion al oamenilor, după ce acesta este luat în vizor de mașinile care au creat Matricea.
Atunci când guvernul își pune toate ouăle penale într-un coș aerian, o caută cu lumânarea. Înainte de a putea spune: „Dă-mi și mie punga de vomitat”, infractorii controlează avionul, conduși de Cyrus „Virusul” Grissom. Urmărindu-i fiecare mișcare este Cameron Poe, ce tocmai a fost eliberat și care ar prefera mai degrabă să se reunească cu familia sa.
Ultima parte a trilogiei Matrix îl găsește pe Neo inconștient, blocat într-o stație de metrou în zona dintre Matrice și lumea mașinilor.
Un spărgător profesionist care e pe cale să dea lovitura vieții. Ținta: o reședință a însuși Președintelui Americii. Spărgătorul Luther Whitney, pândește momentul când președintele pleacă de acasă. Bătrânul vulpoi nu apucă să-și umple buzunarele pentru că Președintele se întoarce inopinant împreună cu o amantă. Jocurile erotice ale celor doi se termină tragic, pentru că președintele, alcoolizat peste măsură, nu-și poate înfrâna morbidele fantezii sexuale și aventura sfârșește cu moartea celei mai invidiate amante din America. Crima nu trebuie aflată niciodată. Pentru că știe prea multe, serviciile secrete vor să-l reducă la tăcere pe Luther … pentru totdeauna.