在5月19日新剧场版《最后的审判》上映前夕，东映将OV版内容再编集为剧场版，5月5日上映《第一季：觉醒》，5月12日上映《第二季：轮回》。

水泽悠和千翼分别代表了亚马逊生物和人类的对立立场。他们的命运逐渐交织，展开了一场无法回避的战斗。悠一方面承受着内心的挣扎，另一方面又不愿意看到人类与亚马逊间无休止的纷争，而千翼则充满了对亚马逊生存权利的抗争之心。电影的核心主题是探讨生存与人性之间的抉择，以及“轮回”概念下的生死斗争，带有深刻的哲学意味。

在全国大赛（高中联赛）中，经过一番激斗，总北高中自行车竞技部的小野田坂道漂亮地取得了综合优胜。在夏季即将结束之际，他为了从即将毕业的三年级生金城、卷岛、田所之处继承“全员相互支撑向前奔驰”的总北队之魂，而每天坚持练习。 某天，总北队收到了历年高中联赛的成绩优秀队伍出场的“熊本 火之国山间比赛”的出场邀请。放言打倒总北而燃烧斗志的箱根学园、京都伏见、广岛吴南这些对手队伍，以及拥有“炎之爬坡者”吉本的本地队伍熊本台一，这些全国的强豪队将会在此次比赛中参赛，而为了准备比赛，坂道等总北成员也士气高涨。然而，只有一人例外——。 现在的总北队的“最后的比赛”，将以熊本、阿苏山为舞台展开。“继承灵魂，并将其超越。”胸中怀着炽热的决心，男儿们再次站在起点线上——！

有一天早上，一个普通的高中女生小苍收到了一个神秘的包裏。拆开包裏，发现里面放的，是被称为“机甲少女（Frame Arms Girl）”的完全自律型小型机器人“轰雷”。是玩具！是模型玩具呢！但是轰雷可不只是普通的机甲少女，而是搭载著比人工智能更高等的AS（Artificial Sel）智能，拥有人工自我人格的最新型试作机。不仅如此，全世界只有小蓝一个人能启动轰雷。为了学习战斗资讯与人类情感而存在的轰雷。一切知识从零开始学起的机甲少女。小蓝与轰雷，人类与机甲少女之间充满奇妙与欢乐，让人笑声不断的日常生活就要开始了！