بعد اختطافهم وسجنهم لمدة 15 عاما , ويتم تحريره أوه داي سو , فقط ليجد أنه يجب أن تجد الآسر له في 5 أيام .
أثناء عودتها إلى الأرض ، تعترض سفينة الفضاء التجارية نوسترومو إشارة استغاثة من كوكب بعيد. عندما يكتشف فريق مكون من ثلاثة أفراد من الطاقم غرفة تحتوي على آلاف البيضات على الكوكب ، يهاجم كائن داخل إحدى البيوض مستكشفًا. الطاقم بأكمله غير مدرك للكابوس الوشيك الذي سيحل عليهم عندما يولد الطفيلي الغريب المزروع داخل مضيفه المؤسف.
عندما تم العثور على أرجل حياة ريبلي من قبل طاقم الإنقاذ بعد أكثر من 50 عامًا ، وجدت أن صانعي التضاريس موجودون على الكوكب ذاته الذي وجدوا فيه الأنواع الغريبة. عندما ترسل الشركة عائلة من المستعمرين إلى الخارج للتحقيق في قصتها - فقد كل الاتصال بالكوكب والمستعمرين. يجندون ريبلي ومشاة البحرية الاستعمارية للعودة والبحث عن إجابات.
يتم اجبار أحد المرتزقة السابقين على انهاء عزلته عندما يخطف ثلاثة رجال غامضين أطفال المدينة ويغسلون أدمغتهم
يصبح (نيو) آخر آمال البشر، فهو الوحيد القادر على فعل المعجزات، ويحاول (نيو) أن ينقذ مدينة زيون التي سوف تقع قريبًا تحت حصار الآلات. يضع الجميع بقيادة (مورفيوس) ثقتهم الكاملة في (نيو)، ويعلقون عليه الآمال بإنهاء الحرب مع الآلات، لا سيما وهم مؤمنون بالنبوءة التي تتوقع نجاحه. يقرر (نيو) وحبيبته (ترينتي) مرافقة (مورفيوس) إلى الماتريكس لمحاولة الوصول إلى قلب النظام عن طريق صانع المفاتيح. في الوقت ذاته ينجو العميل (سميث) من الإلغاء، ويصبح أكثر قوة عن ذي قبل، ويضع نصب عينه هدفًا أساسيًا هو ملاحقة (نيو).
يروي الفيلم قصة طاقم المحطة الفضائية الدولية المُكوّن من ستة أفراد، والذين على شفا واحد من أهم الاكتشافات في التاريخ البشري، ألا وهو أول دليل على وجود حياة خارج الأرض على كوكب المريخ، وبمجرد شروعهم في إجراء بحوثهم يبلغون عواقب غير متوقعة ويكتشفون أن شكل الحياة هناك أكثر ذكاءًا من توقعات أي شخص.