כאשר ג'רי חש עצב רב על שעליו לחכות עוד שנה שלמה כדי לראות שוב את "מפצח האגוזים", מתחולל קסם, וג'רי הופך להיות מלך העכברים. באותו זמן, מלך החתולים מנסה להשמיד את ג'רי ולכך שולח את עבדו הנאמן טים... (סליחה, טום) כאשר מלך החתולים חוטף את הבלרינה, על ג'רי להצילה מידו האכזרית של מלך החתולים. סרט חדש ונחמד, שכולו מחווה יוצאת מן הכלל ל-"מפצח האגוזים" האגדי.
הצטרפו לעוד הרפתקאה נהדרת לכל המשפחה של החתול והעכבר המפורסמים ביותר על המסך: טום וג'רי! בסרט שני האויבים המושבעים פוגשים חייזרים מכוכב מאדים שמתכננים לפלוש לכדור הארץ. הם משתפים פעולה כדי למנוע את פלישתם של החייזרים, אך לא לפני שהם מספקים לנו את מנת המרדפים המשעשעים והמטורפים שהפכו לסמלם המסחרי. בעזרת רובוט ענקי בצורת שואב אבק ("אינביסיטרון"), טום וג'רי והחיל השלם של מאדים יוצאים להציל את כדור הארץ.
טום עוזב את הבית לכמה זמן, ובמשך הזמן הזה ג'רי מסתבך ובטעות נדבקת לו לראש טבעת יקרה מאוד של נסיכה. הוא קורא לחבר שלו שהוא קוסם כדי שינסה להוריד אותה ויחזיר אותה לנסיכה.
הרפתקה מוזיקלית וקסומה שמעירה לחיים את טום וג'רי, ככל הנראה הצמד המצויר המפורסם ביותר בכל הזמנים.
כאשר טום וג'רי מוצאים ביצה מוזרה ביער ושיצא לאוויר הפתוח כדי לייצר דרקון תינוק, הם מוצאים את עצמם נאלצים לעשות בייביסיטר ליצור הקטן.
כעת כשהמכשפה המרשעת נעלמה מארץ עוץ, טום וג'רי, ביחד עם דורותי, שום חוזרים לקנזס. אך השקט לא נשמר לזמן רב, משום שנבל חדש מגיח ממעמקי העיר הקסומה: המלך המרושע! לאחר שחטף את המכשפה הטובה, המלך המרושע וצבאו זורעים הרס בארץ עוץ, כשרק דבר אחד מונע מהם לשלוט בארץ עוץ: הנעליים האדומות של דורותי! כעת מוטל על החתול והעכבר האהובים לחזור לארץ עוץ ולהציל את המקום שהם כה אוהבים עם הקוסם, דורותי, טוטו, הדחליל, איש הפח והאריה הפחדן.