Au terme d'un combat dantesque, Gridman a vaincu Alexis Kerib et le calme semble être revenu sur le monde. Mais lorsque Rikka et Utsumi écrivent une pièce de théâtre sur Gridman pour la fête du lycée, un nouvel engrenage se met en marche vers la fin du monde, un engrenage qui pourrait bien entraîner d'autres dimensions…

Mei, 4 ans, et Satsuki, 10 ans, s’installent à la campagne avec leur père pour se rapprocher de l’hôpital où séjourne leur mère. Elles découvrent la nature tout autour de la maison et, surtout, l’existence d’animaux étranges et merveilleux, les Totoros, avec qui elles deviennent très amies. Un jour, alors que Satsuki et Mei attendent le retour de leur mère, elles apprennent que sa sortie de l’hôpital a été repoussée. Mei décide alors d’aller lui rendre visite seule. Satsuki et les gens du village la recherchent en vain. Désespérée, Satsuki va finalement demander de l’aide à son voisin Totoro.

Astra Ludger Doomsday, ancien capitaine des chevaliers royaux, a finalement réalisé son vœu le plus cher : se retirer et utiliser ses économies pour obtenir sa propre maison. Cependant, peu de temps après son arrivée dans sa nouvelle maison, une jeune fille s'écrase chez lui. S'appelant Noah, elle est une apprentie sorcière et semble confondre Astra avec une autre personne.

Kijima Naito et Fei Zhui Lau sont des fugitifs d'un laboratoire qui étudie cruellement les effets du Sacred Seven sur les humains.

Dans un Japon futuriste régi par l'Internet, le major Motoko Kusunagi, une femme cyborg ultra-perfectionnée, est hantée par des interrogations ontologiques. Elle appartient, malgré elle, à une cyber-police musclée dotée de moyens quasi-illimités pour lutter contre le crime informatique. Le jour où sa section retrouve la trace du 'Puppet Master', un hacker mystérieux et légendaire dont l'identité reste totalement inconnue, la jeune femme se met en tète de pénétrer le corps de celui-ci et d'en analyser le ghost (élément indéfinissable de la conscience, apparenté à l'âme) dans l'espoir d'y trouver les réponses à ses propres questions existentielles...

Dans un Tokyo abandonné, infesté de bulles et d'anomalies gravitationnelles, le destin rapproche un jeune homme brillant et une jeune fille mystérieuse.

L'équipe n° 7 (Kakashi Hatake, Naruto Uzumaki, Sasuke Uchiwa et Sakura Haruno) est investie d'une mission de rang C : escorter Shibuki, le chef du village caché de Taki du Pays de la Cascade, lors de son voyage de retour vers son pays. La mission se déroule sans problèmes, mais une fois arrivés au village, ils rencontrent des renégats dont le but est de s'emparer de « l'eau des héros », eau magique délivrant une puissance extraordinaire à celui qui la boit (non sans effets secondaires). Le jeune chef de Taki va devoir trouver en lui la force et la confiance nécessaire pour repousser l'envahisseur. Sasuke et Naruto seront là pour l'aider…

Passionnée de foot, la jeune Suô vient de rentrer au lycée et espère bien continuer ce sport qu'elle apprécie tant. Le problème est qu'elle n'a jamais gagné un seul match durant sa scolarité au collège. Mais une nouvelle rencontre risque de changer cet état de fait...

Le second spécial est accès sur la fuite de l'Archangel en direction de l'Alaska, ainsi que son arrivé à Orb. C'est dans cette partie qu'aura lieu le combat de Kira et Asran.

Alors que Pop doit se rendre dans le monde magique pour passer un examen de magie, Hana la suit. En essayant de la rattraper, Pop découvre dans le jardin de la reine une fleur différente des autres. Curieuse, Pop cueille la fleur et la rapporte dans le monde des humains. Seulement, cette fleur est la "Witch Queen Heart", une fleur très rare qui a le pouvoir d'exaucer les vœux. Si le vœu est bon, la fleur restera blanche, mais si le vœu est mauvais, elle changera de couleur et finira par se répandre dans toute la ville, réalisant les vœux de tout le monde. Après une dispute avec sa sœur, Doremi, Pop souhaite qu'elle cesse d'être une sorcière et devienne un rat, ce qui fait changer la fleurdecouleur.Commence alors une course contre la montre pour retrouver Doremi et empêcher la fleur de causer des dégâts.

La bataille finale et les révélations seront un peu plus nombreuses que dans la série. Les noms des parents de Kira y sont dévoilés, ainsi que le visage de Raw le Creuset.

Lupin est soupçonné du meurtre d'un professeur nommé Theo Argent. Le professeur venait de découvrir la page manquante du carnet d'observations de Marco Polo dans le journal de voyage de l'Est. Alors que Lupin est poursuivi par la police, il finit par obtenir l'aide improbable de la petite-fille de Theo Argent, Lisa.

Peu après que l'humanité ait développé un réseau surpuissant sur lequel il est possible de se connecter par le biais de son esprit, pendant que le corps est maintenu en cuve, un accident majeur survient, causant la mort d'une grande partie des utilisateurs. Seul l'esprit de quelques uns a pu revenir, mais à cause de l'amnésie qu'a causé le désastre, rien ne garantit que leur corps actuel soit le bon.