Džims Felpss nosūtīts uz Prāgu, kur jāizpilda misija ar mērķi nepieļaut klasificēta materiāla nozagšanu. Viņa sieva Klēra un uzticamais partneris Ītans Hants reiz jau bijuši Felpsa komandas biedri. Diemžēl šoreiz kas noiet greizi, un misija izgāžas, atstājot Ītanu kā vienīgo izdzīvojušo. Aģentūra, kas Džimu nosūtījusi, uzskata Ītanu par nodevēju un patieso vaininieku. Nu Ītanam jāliek lietā netipiskas metodes, lai izdotos atgūt savu slavu.

Atvaļinājies no aktīvā dienesta, apmācot rekrūšus Neiespējamās misijas spēkiem, aģents Ītens Hants sastapsies ar sīvāko dzīves izaicinājumu - Ovenu Deivienu, kurš ir nežēlīgs starptautiskais ieroču un informācijas brokeris. Deiviens apdraud Hantu un visus, ko viņš uzskata par tuviem - tostarp sievieti, ko viņš mīl. Nu Hantam jāliek lietā visas savas zināšanas, lai nogalinātu Deivienu.

Īpašais aģents Ītens Hants nosūtīts misijā pārņemt un iznīcināt ģenētiski sintizētu slimību "'Čimera". Viņam jāsacenšas ar starptautisku teroristu bandu, kuru vada bijušais IMF aģents - viņiem "Čimera" nepieciešama, lai piepildītu lielo plānu inficēt visus pasaules iedzīvotājus. Lai pārtvertu teroristu grupējumu, Ītenam jāuzticas palīdzībai no starptautiskas noziedznieces Nijas, pret kuru ātri vien parādas romantiskas tieksmes.

Džūnijs un Karmena dodas uz kādu noslēpumainu salu, kur viņi sastop ģenētisko zinātnieku un konkurējošus spiegu bērnus.