Etter hennes triumf på Miss America-skjønnhetskonkurransen blir FBI-agenten Gracie Hart kjendis over natten - og det nye "FBI-ansiktet" utad. Men det er på tide å gå til aksjon igjen når skjønnhetskonkurransens vinner, Cheryl, og konferansier, Stan, blir bortført.

På sitt andre store oppdrag må Cody igjen seile under falskt flagg. Nå er han nødt til å utgi seg for å være klarinettist i verdensklasse med en naturlig plass i et stort ungdomsorkester.

For venner og familie er Cody Banks en helt vanlig tenåring. Han elsker å skate, hater matte og føler seg komplett ubrukelig i nærheten av jenter. Men Cody har en hemmelighet; han deltar i et spesialprogram for tenåringsagenter i den amerikanske etterretningsorganisasjonen CIAs regi. Cody lever enhver tenårings drømmetilværelse. Han kjører bil like stødig som en stuntmann, har et avsindig arsenal av kule duppeditter, og hans mentor Ronica Miles i CIA er den dama! Men Codys trening blir utsatt for den store prøvelsen når han skal forestille en ordinær skoleelev og gjøre seg til venns med superdeilige Natalie Connors. Oppdraget består nemlig i å spionere på Natalies far, en vitenskapsmann i ferd med å utvikle en dødelig flåte av "nanoboter" med krefter nok til å ødelegge planeten.