Mladi astronom amater i njegov učitelj otkriju na nebu čudan objekt između zvijezda, ni ne sluteći kako je riječ o kometu koji se nalazi na izravnoj putanji u smjeru Zemlje, s kojom će se sudariti uz izuzetno tragične posljedice. Američki predsjednik naciji objavi postojanje kometa, uz napomenu da nema mjesta panici jer će NASA poslati tim prokušanih astronauta čija će misija zaustaviti komet. No, kada se planirana misija izjalovi te postane jasno kako je sudar neminovan, predsjednik obznani kako će se izgraditi posebne špilje u koje će skloniti 200 tisuća znanstvenika, vojnika i drugih službenika, kao i 800 tisuća običnih Amerikanaca, kako bi nakon udara bili u stanju obnoviti život. Međutim, vijest kako će se sretnici izvlačiti lutrijom ne nailazi na razumijevanje...

Godina je 2415., 400 godina je prošlo otkad je smrtonosni virus polovicu čovječanstva zbrisao s lica Zemlje. Preživjeli prebivaju u Bragni, utvrđenom gradu okruženom zidom kako bi zaštitio zdrave od virusom zaraženog ostatka planeta. Æon Flux (Charlize Theron) je tajanstvena žena ubojica koja radi za skupinu odmetnika koja se kreće kroz gradsko podzemlje, a predvodi je Handler (Frances McDormand). Æonin novi zadatak je usmrtiti Trevora Goodchilda (Marton Csokas), člana vijeća koje upravlja gradom. Međutim, kada Æoninu mlađu sestru ubiju vladini agenti, ona zanemaruje naredbe te odlučuje zaštititi Trevora jer pretpostavlja da mu brat Oren (Jonny Lee Miller) namješta igru. Handler doznaje da se Æon oglušila o naredbe te naređuje da je se kao neposlušnu eliminira. Æon riskira sve što ima, ali u bijegu otkriva mnoge tajne i odgovore na pitanja o vlastitoj, nepoznatoj joj prošlosti, kao i o pravoj istini o pozadini grada Bragna.

Dolazi do groznog masakra nakon što se izopćenoj tinejdžerici izruguju srednjoškolski sportaši koji ne znaju za njezine telekinetičke moći.