הסרט מגולל את סיפורה של משפחת קורליאונה, שהיא אחת מהמשפחות השולטות על המאפיה הסיצליאנית בניו יורק לקראת אמצע המאה ה-20. הסרט מתאר את התהליך שבו הגיבור הטוב הופך להיות הגיבור הרע. מייקל הוא גיבור מלחמה אמריקאי, שבוחר בעקבות הנסיבות לפעול על פי הקוד המשפחתי, ולא להתנתק מן הפשע.
מייקל קורליאונה לא בוחל באמצעים כדי להרחיב את אימפריית הפשע של משפחתו, ונזכר בדרך שעשה אביו ויטו מבית היתומים בסיציליה ועד לימיו כסנדק של ניו יורק.
פושע קטן משתחרר מהכלא לאחר חמש שנות מאסר ומתכנן לשדוד שני מיליון דולר ממסלול מירוצים. הכול מסתבך כשאחד מהשותפים מחליט שיש לו תוכניות משלו. לכאורה, העלילה סתמית וכבר נעשו אינסוף סרטים כאלה; בפועל, משתמש סטנלי קובריק (בסרטו הארוך השלישי) בעלילה שנעה קדימה ואחורה על ציר הזמן, במעברים חדים בין הדמויות כדי להציג יצירה מורכבת ואפלולית ששימשה בהמשך כבסיס לסרטים רבים אחרים, ביניהם "כלבי אשמורת" של טרנטינו. באופן מבריק מגיש לנו קובריק יצירה בעלת מאפיינים פוסט-מודרנים בחבילה פילם-נוארית.
אחרי מותה, אם חוזרת לעיר הולדתה כדי לתקן מספר בעיות שלא היתה מסוגלת לפתור במהלך חייה. משפחתה נשארה בעיירה והרוח שלה מתפקדת כנחמה עבור שתי בנותיה ונכדתה.