Ystävykset Robert ja Alfred ovat taikureita, joista tulee toistensa kilpailijoita. Kun Alfred esittelee kaikkien aikojen temppunsa, Robert haluaa tietää, kuinka se tehdään. Mutta mitä enemmän hän tutkii temppua, sitä enemmän alkaa näyttää siltä, ettei mitään temppua olekaan.

Aikakone perustuu H. G. Wellsin samannimiseen romaaniin (1895) ja sen tapahtumat alkavat uudenvuoden aattona 1899, kun seurue Georgen ystäviä kokoontuu illastamaan. George saapuu henkihievereissä verstaastaan ja kertoo lähes koko elokuvan kestävässä takautumassa tarinansa aikamatkasta. Kelkkaa muistuttavalla aikakoneellaan George liukuu ensin vuoteen 1917, kunnes päätyy uudelleen sodan ympäröimään maailmaan vuonna 1940. Tämän jälkeen aikakone hurahtaa tulevaisuuteen, vuoteen 1966, ja sielläkin riehuu sota - ydinsota. Täydellisestä katastrofista ihmiskunta on toipunut vasta vuonna 802701: se on kuitenkin jakaantunut kahtia, maan pinnalla eläviin elohin ja pimeydessä vaeltaviin morlokeihin. Morlokit eivät kutenkaan ole maan alle työnnettyjä työläisiä vaan riistäjiä, jotka ovat muuttaneet eloit tahdottomiksi kasveiksi. Aikakone kommentoi paratiisimyyttiä ja edistysuskoa - paratiisi näyttäytyy irvokkaana taantumuksena, josta puuttuu kehityksen edellyttämä haaste.

Sade piiskaa öistä valtamerta. Laivoja vajoaa meren syvyyksiin. Panaman metsistä ja Jamaican rannikolta löytyy tuhoisan olennon jalanjälkiä. Otus tallustaa kohti USA:ta, ja biologi Niko Tatopoulos kutsutaan hätiin. Hän saa selville, että radioaktiivinen laskeutuma on luonut jättiläishirviön, jolle ihmisen aseet ovat pelkkää hyttysen ininää. Ja louskuleuka lähestyy jo uhkaavasti New Yorkia...