Početkom 60-tih, zbog političkih neslaganja vezanih za Alžirski rat, francuska paramilitarna organizacija planira atentat na francuskog predsjednika Charlesa De Gaullea (Adrien Cayla-Legrand). Kada državne službe doznaju da je život predsjednika u opasnosti, pokrenute su iznimne mjere opreza kako bi se spriječio bilo kakav pokušaj ugrožavanja života prvog čovjeka Francuske. No terorističke postrojbe pronalaze osobu koja bi mogla izvršiti ovaj nemogući zadatak. Poznat pod tajnim imenom Šakal, profesionalni ubojica (Edward Fox) pristaje obaviti zadatak. Policija od doušnika saznaje za atentatora, a policijski inspektor Lebel (Michel Lonsdale) korak po korak približava se ubojici.
Nakon što je izgubio pamćenje i jedinu osobu koju je volio, Bourne je prisiljen razotkriti svoju prošlost kako bi mogao imati budućnost. Putujući od Moskve, Pariza, Londona do Tangera i New Yorka, nastavlja potragu za pravim Jasonom Bourneom – cijelo vrijeme nastojeći nadmudriti brojne policajce, savezne časnike i Interpolove agente koji ga drže na nišanu.
Dva bostonska detektiva istražuju otmicu male djevojčice a istraga vremenom postaje i profesijonalni i privatni problem.
Prošlost Jason Bournea vraća se po njega. U drugom dijelu sage o tri filma koja se temelji na životu Jason Bournea, bivšeg CIA-inog agenta koji gubi pamćenje i dok se bori da ga oporavi i otkrije tko je on, našao se uključen u mrežu špijunaže i vladine manipulacije od strane Sjedinjenih Država gdje će ga progoniti profesionalni ubojice, paravojni plaćenici i bivši CIA-ini drugovi. Film započinje u Goi u Indiji, gdje su Jason i Marie otišli živjeti da bi se sakrili od Treadstonea, ali tamo ima bivšu tvrtku agent ih locira i progoni. Jason Bourne započinje svoju avanturu da otkrije svoju prošlost sjećanjem se dijela toga i progoni agenta koji se također predstavlja kao on.
Mladi novinar, sezonski snimatelj i diskreditiran ratni dopisnik kreću u neodobrenu misiju da u Bosni pronađu zločinca br. 1. Nađu se u ozbiljnoj opasnosti kad ih zamijene s CIA-om i kad njihova meta odluči krenuti za njima.
New York, 1940. Dr. Jorge Vargas (J. Curry) posljednji je u nizu uglednih svjetskih znanstvenika koji su nestali u kratkom vremenu. Prije svog nestanka dr. Vargas poslao je važnu poruku svom kolegi dr. Walteru Jenningsu (T. Baxter) koji stupa u kontakt s fotoreporterkom Polly Perkins (G. Paltrow). Polly ne uspijeva doznati o čemu je riječ, a slijedi invazija divovskih robota koji počnu uništavati grad, ali i ostale svjetske metropole. Nakon dolaska hrabrog pilota Joea Sullivana zvanog "Gospodar neba" roboti se iznenada zaustave što svjetske vlade natjera da počnu planirati obranu od mogućega novog napada. Polly s Joeom s kojim je nekada bila u vezi počne razotkrivati veliku urotu iza koje stoji zagonetni dr. Totenkopf (L. Olivier). Uz pomoć svoje kolegice Franky Cook (A. Jolie) i mladog inovatora Dexa (G. Ribisi) Joe krene prema Totenkopfovu skrovištu odakle on planira uništenje svijeta.