Dobro došli u Animatrix, vizionarsku fuziju CG-animacije i japanskog animea najpriznatijih anime redatelja. Proživite događaje koji su bili predigra Matrixu i saznajte što se dogodilo s posljednim gradovima ljudi, ratu sa strojevima i konačnoj propasti čovječanstva.

Usred budućeg rata između ljudske rase i snaga umjetne inteligencije, Joshua, okorjeli bivši agent specijalnih snaga koji tuguje zbog odlaska svoje žene, regrutiran je da ulovi i ubije Stvoritelja, nedostižnog arhitekta napredne umjetne inteligencije koji je razvio tajanstveno oružje s moći da okonča rat i samo čovječanstvo. Misija spašavanja svijeta vodi do moralne dileme kada Joshua sazna da je najveći neprijatelj čovječanstva – dijete.