Pitkästynyt pikkukaupungin tyttö Mitsuha uneksii elämästä komeana tokiolais-poikana. Eräänä aamuna Mitsuha tosiaan herää menevän Takin kehossa. Tokiolainen Taki herää samaan aikaan suloisena Mitsuhana. Totaalista ensihämmennystä seuraa innostus. Kumpikin pääsee tutkimaan... toista puolta itsessään. Taki ja Mitsuha oppivat jättämään viestejä toisilleen, toiselle minälleen. Mutta onko kosminen yhteys liian kaunis kestääkseen?
Kymmenen vuotta MONSTERS:in tapahtumien jälkeen ”Tartuntaalueet” ovat levinneet maailman joka kolkkaan. Kaksi sotilasta lähtevät suorittamaan heidän elämänsä mullistavaa tehtävää Keski-Idän aavikoilla, läpi hirviöterritorion pimeimmän ytimen. Heidän saavuttaessa päämääränsä on heidän ollut pakko kohdata pelko siitä, että planeettamme todelliset hirviöt eivät välttämättä olekaan muukalaisia.
Ystäväporukka kokoontuu viettämään railakasta iltaa yhdessä. Elämä hymyilee. Hauskan illan huipentaa porukkaan kuuluvan pariskunnan kihlautuminen. Hempeilyn keskeyttää outojen tapahtumien sarja. Ensin sähkökatko pimentää koko kaupungin. Sitten mykistyvät puhelinverkot. Tämä on kuitenkin vasta alkua, sillä äkkiarvaamatta synkät varjot täyttävät taivaan: Ufoja! Suuria! Maapallon valloitus on alkanut. Riemukas illanvietto muuttuu armottomaksi selviytymiskamppailuksi kaoottisten tapahtumien keskellä. Kuinka ystävysten käy? Ja miltä näyttää maapallon tulevaisuus, kun pöly vihdoin laskeutuu?
Yksinäinen ovimies törmää tuttuun naiseen - jota ei ole tavannut ennen. Kaksikolle syntyy ennenkokemattoman yhteyden tunne ja aika pysähtyy paikalleen. Juuri kun yhteinen tulevaisuus alkaa loistaa horisontissa, astuu esiin aikuiseksi kasvaneen pojan tukahdutettu lapsuus. Hän asettaa vaakalaudalle sekä sydämensä että mielensä, kun kielletyt aikamatkustusleikit muuttuvat todeksi.