Harry Potter eta bere adiskideak Hogwarts ikastetxean hirugarren ikasturtea hasi bezain azkar misterio batekin topo egingo dute: Azkaban aztientzako espetxetik Sirius Black presoak ihes egin berri du, Lord Voldemorten kide arriskutsua, eta Harry Potteretaz mendekatzeko asmoa du. Azti ikasle gaztetxoak ein handi batean Sirius espetxeratu zezaten lagundu zuen, beraz Harryk beldurra izateko arrazoiak soberan ditu.

2035ean, James Cole kondenatua gogoz kontra denboran atzera bidaltzeko boluntarioa da, lurreko ia populazio osoa desagerrarazi eta bizirik atera zirenak lurpeko komunitateetara behartu zituen birus hilgarri baten jatorria ezagutzeko. Baina Cole oker 1990era bidali beharrean 1996ra bidaltzen dutenean, atxilotu eta buruko ospitale batean giltzapetu dute. Bertan Kathryn Railly doktorea psikiatra eta Jeffrey Goines pazientea ezagutuko ditu, birusen aditu ospetsu baten semea, zeinak izan lezakeen giltzarria talde malkartsu misteriotsuaren, 12 Tximinoen Armada, gaixotasun hiltzailea askatzeko arduraduna dena.