Какво е Матрицата? Имали ли сте някога сън, който е бил наистина реален? Какво ще стане, ако не може да се събудите от такъв сън? Как бихте могли да направите разликата между сън и реалност? Когато красива непозната отвежда компютърния хакер Нео до забранения подземен свят, той открива шокиращата истина - животът, който познава, е сложна измама на зъл изкуствен интелект. Нео се присъединява към легендарния и опасен бунтовник Морфей в битка да унищожи илюзията, която владее човечеството. Сега, всеки ход, всяка секунда, всяка мисъл се превръща в борба а оцеляване. И борба да избяга от "Матрицата".

Нео вече разполага с по-голям контрол върху свръхестествените си сили, след като Зион пада под обсадата на Армията на Машините. Само часове делят последният човешки анклав на Земята от 250,000 стражи, програмирани да унищожат човечеството. Но за гражданите на Зион, насърчавани от обещанието на Морфей, че Един ще изпълни Пророчеството на Оракула и ще донесе победа във войната с Машините, всички надежди и очаквания са съсредоточени в Нео. А той се сблъсква с объркващи видения, докато търси посоката, в която да действа.

Нео е впримчен в ничията земя между Матрицата и Света на машините. Докато Тринити бди над тялото му, Морфей се бори с разкритието, че Избраният е просто още една система за контрол, изобретена от архитектите на Матрицата.