Η ιστορία εξελίσσεται δύο χρόνια μετά το τέλος του παιχνιδιού. Μια ασθένεια ονόματι "Geostigma" μαστίζει τον κόσμο. Ο κεντρικός ήρωας, Cloud Strife, θα πρέπει να αντιμετωπίσει τρεις μυστηριώδεις άνδρες που απαγάγουν μικρά παιδιά και τους κάνουν πλύση εγκεφάλου. Στο πλευρό του θα σταθεί η Tifa Lockhart, η οποία είναι πλέον ιδιοκτήτρια ορφανοτροφείου και φυσικά και άλλοι χαρακτήρες από το final fantasy VII όπως ο Vincent Valentine.

Η ιστορία της ταινίας αφορά στον τρόπο με τον οποίο ο ήρωας του Whisaw θα προσπαθήσει να έρθει σε επαφή με την συντετριμμένη μητέρα του αγαπημένου του και να επικοινωνήσει μαζί της, παρά τους περιορισμούς που τους επιβάλει η διαφορετική γλώσσα. Σύντομα οι δυο τους θα ακολουθήσουν ένα κοινό μονοπάτι θλίψης, αλλά και λύτρωσης, αποδεικνύοντας πως οι άνθρωποι μπορούν να κοινωνήσουν και να μοιραστούν συναισθήματα, ιδιαίτερα όταν η κινηματογραφική γλώσσα μετατρέπεται τελικά, στο υπέρτατο εργαλείο λεκτικής και μη, σύνδεσης.