Młody Amerykanin żydowskiego pochodzenia przybywa na Ukrainę w poszukiwaniu kobiety, która w czasie wojny ocaliła jego dziadka. W pogmatwanych lecz zabawnych poszukiwaniach pomagają mu wyjątkowo niekompetentny tłumacz i starzec nawiedzany przez wojenne wspomnienia.

Minęły dwa lata od ostatecznej bitwy z Sephirothem. Choć Midgar, miasto mako, miasto dobrobytu, zostało zredukowane do ruin, jego mieszkańcy powoli, lecz systematycznie kroczą drogą ku odbudowie. Jednak tajemnicza choroba zwana Geostigmą dręczy ich. Nie ma na nią lekarstwa, a jej ofiara umiera jedna po drugiej, pozbawiając ludzi resztek nadziei.

Ona jest starą Chinką, która opłakuje śmierć syna, a on jego najlepszym przyjacielem. Mimo trudności w porozumieniu się i początkowej niechęci oboje zaczynają wspominać ukochanego oraz wzajemnie poznawać.

Akcja filmu rozgrywa się podczas letnich regat wioślarskich i skupia się na miłosnych perypetiach grupki nastolatków u progu dorosłości. Odkąd związek Achima z jego dziewczyną stał się bardziej poważny, Tobi czuje się coraz bardziej pomijany i zdezorientowany. Z każdym następnym aktem bohaterowie nieuchronnie zmierzają do konfrontacji równie zaciekłej i wyzwalającej jak sama letnia burza.

Walka pomiędzy Ziemskim Sojuszem (Naturalnymi) a organizacją ZAFT (Koordynatorami) trwa. Kira Yamato wraz ze statkiem Archanioł kontynuuje podróż po Ziemi. Znajdują oni końcu schronienie w neutralnym państwie – Królestwie Orb. Athrun i reszta pilotów – koordynatorów nie mogą uwierzyć w fakt, że Archanioł został zniszczony zgodnie z zapewniami Królestwa Orb. Wkrótce dochodzi do najkrwawszej walki miedzy Kirą a Athrunem – przyjaciółmi z dzieciństwa. Podczas walki oba Gundamy zostają zniszczone a po Kirze nie zostaje ślad. Archanioł dociera na Alaskę gdzie znów musi stanąć do walki, ponieważ ZAFT realizuje wielką operację militarną przeciwko Ziemskiemu Sojuszowi. Calem ataku stają się bazy na Alasce i w Panamie. Poczynania Archanioła zostają uznane przez Sojusz Ziemski jako zdrada.