Plus qu'un simple documentaire, La Sorcellerie à travers les Âges défie toutes les frontières de genres et de style en étudiant la nature de la sorcellerie et du satanisme, de la Perse Antique aux temps modernes.
Trois jeunes séminaristes quittent leur monastère pour partir en vacances. La nuit, ils se font héberger par une fermière qui se révèle être une sorcière. Khoma l’empoigne et la laisse pour morte, après qu’elle se soit transformée en jolie jeune fille. Sous la pression de la famille, le recteur oblige Khoma à passer trois nuits auprès de la défunte afin de prier pour son âme. Il va vivre trois nuits d’épouvante jusqu’à l’apparition de VIJ, le démon et maître des Gnomes…
A Okamidani, les bruits qui proviennent de la montagne sacrée font craindre que ne se réveille Majin, un esprit guerrier enfermé dans une statue de pierre. Alors que se déroule une cérémonie destinée à l'apaiser, Hanabusa, le seigneur des lieux, est attaqué et tué dans sa demeure. Grâce à la réussite de ce complot, Samanosuke Odate devient le nouveau maître de la région, sur laquelle il va désormais faire régner la terreur. Le seul endroit où les enfants du seigneur assassiné peuvent désormais être en sécurité est la montagne interdite, résidence de Majin.
Un maître sculpteur et son apprenti sont pris au piège dans une mauvaise tempête de neige après avoir trouvé un arbre spécial pour sculpter une statue pour le temple local. Ils trouvent refuge dans une cabane abandonnée et célèbrent la chance qu'ils ont eue de trouver l'arbre, mais ils reçoivent bientôt la visite de la sorcière des neiges, qui fait mourir de froid le sculpteur mais a pitié de l'apprenti. Il doit promettre de ne jamais parler de cela ou elle reviendra et le tuera.
Une étudiante est envoyée par son professeur dans un village perdu faire des recherches sur des pratiques anciennes de sorcellerie. Arrivée dans son hôtel elle commence à entendre d'étranges bruits qui semblent provenir d'une trappe dans sa chambre.
Hospitalisé à la suite d'un accident de voiture, un jeune homme revit les évènements qui ont précédé sa perte de connaissance. En attendant que sa voiture soit réparée, il s'était réfugié dans une famille au comportement étrange : ces gens étaient terrorisés par l'apparition de créatures nocturnes qui tuent les êtres qu'elles aiment pour échapper à leur propre solitude.
Un adolescent provocant, aux prises avec le divorce imminent de ses parents, affronte une sorcière de mille ans qui vit sous la peau de la femme d'à côté et se fait passer pour elle.
Alors que la première épidémie de peste bubonique ravage l'Angleterre, un jeune moine nommé Osmund reçoit la mission d'accompagner un groupe de chevaliers, menés par le rustre Ulric, pour enquêter sur d'étranges phénomènes se produisant dans un petit village reculé. Il semblerait en effet que, en ce lieu, les morts reviennent à la vie. Comprenant que cela est le fait d'un nécromancien ayant un lien particulier avec le village, ils se lancent à sa recherche et finissent bientôt par le trouver en la personne de la mystérieuse beauté Langiva. Mais quand Osmund, déchiré entre son amour pour Dieu et celui pour une jeune femme, accepte de passer un pacte avec la nécromancienne, l'horreur de son véritable voyage ne fait que commencer...
En Afrique, une professeur d'anglais tombe en dépression après avoir eu un conflit avec un marabout local. De retour en Angleterre pour se reposer, elle entame une nouvelle vie en enseignant dans une petite ville. Mais très vite, elle s'aperçoit que l'anodine cité est le refuge de sorcières.
Un jeune homme est harcelé par un cauchemar étrange et récurrent dans lequel il se voit échapper à quelqu'un en courant, avant de parvenir à une vieille maison où une affreuse vieille femme cuit sa propre tête dans une bouilloire. Sa petite amie estime qu'il serait bon pour lui de prendre quelques jours de congé. Ainsi, le couple se rend dans un vieux manoir appartenant à la famille de la jeune fille. Il s'avère que la maison ressemble étrangement à celle présente dans le rêve du protagoniste.
Alors qu’elle rentre seule d’une soirée, la photographe de mode Valentina fait la connaissance d’une femme mystérieuse prénommée Baba Yaga. Peu de temps après, Valentina semble comme envoûtée par l’image de Baba Yaga et des évènements curieux se produisent autours d’elle. La jeune femme a des visions, la réalité semble irréelle…
Lorsque la cousine de Rachel, Julia, vient vivre dans sa famille, des faits troublants apparaissent. Les rapports de Rachel vis-à-vis de sa famille vont aller en se dégradant, alors que ceux de Julia prendront une grande importance. Elle fera renvoyer le petit ami de Rachel tandis que le père et le frère de celle-ci succomberont à son pouvoir. Rachel devra se battre seule pour découvrir quelles sont ces forces démoniaques qui ont transformé sa vie en un véritable cauchemar.
Approchant la quarantaine, Joan Mitchell s'ennuie ferme au foyer. Elle vit dans une petite banlieue pavillonnaire que la famille s'apprête à quitter. Son mari Jack est un homme d'affaires distant, et sa fille Nikki est une jeune fille ...distante. Bref, Joan a une vie morose. Après avoir rendu visite à une voyante qui l'encourage à vivre ses propres rêves, Joan se persuade qu'elle a tous les talents recquis pour devenir une parfaite sorcière. Cette séance de tarot a déclenché la crise chez la ménagère et l'être démoniaque qui sommeille en elle. Bientôt rêve et réalité se confondent de plus en plus pour elle, et la situation tourne à la tragédie.
Un groupe de jeunes étudiants surfers, découvrent un jeu appelé Mamba... qui se trouve avoir des pouvoirs démoniaques. Chaque fois que quelqu'un perd, il meurt dans d'extrêmes souffrances. Le survivant va alors tenter le tout pour le tout et relancer les dés pour essayer de faire revenir tous ses amis. A moins qu'il perde la vie lui aussi...
Quelque part en Europe, dans une petite ville… Albino, un sadique, et sa bande de brutes font régner la terreur en assumant les fonctions de "chasseurs de sorcières" locaux. En fait, ils tuent et violentent au gré de leur seul bon vouloir, s'en prenant souvent à des jeunes femmes n’ayant rien à se reprocher ou à des savants trop en avance sur leur époque… Ces méfaits prennent fin lorsque le Comte Cumberland, un nouveau juge, arrive dans la région et reprend les choses en main. Il est assisté par Christian, son jeune élève, lequel s'éprend de Vanessa, une belle femme qu'Albino veut faire condamner pour sorcellerie…