Que reste-t-il d’une vie de luttes ? Les Sœurs Auxiliatrices du Québec, qui ont foi en Dieu, mais pas en une Église dominée par des hommes, préparent la disparition de leur communauté religieuse.
Homer Smith est un homme à tout faire itinérant. Un jour qu'il se promène dans le désert de l'Arizona, il tombe sur un groupe de nonnes allemandes qui lui demandent de bien vouloir réparer leur toit. Il accepte et s'exécute. Il demande alors à se faire payer, mais la mère supérieure se fait attendre. Elle lui propose alors de les aider à bâtir une chapelle. Au début, il refuse, puis, finalement, s'exécute, et mène sa tâche à bien. Une fois le travail terminé, il s'en va sans demander son argent.
La plupart des grandes hérésies sont évoquées, ainsi que les rapports entre la religion et l'ordre social ou la vie intime dans un climat souvent onirique ainsi qu'il est de coutume chez Buñuel.
En 1944, dans le Pacifique sud, après avoir essuyé une attaque des Japonais, le caporal Allison se trouve à la dérive sur un canot pneumatique. Il finit par échouer sur une île paradisiaque, abandonnée de ses habitants à l'exception d'une religieuse, sœur Angela. La cohabitation du soldat et de la nonne s'avère difficile. Elle est sensible et cultivée, lui est un rustre qui n'a connu que les Marines.
Une jeune femme américaine est envoyée à Rome pour entamer une nouvelle vie au service de Dieu. Bientôt, elle est confrontée à une noirceur qui lui fait interroger sa foi et qui met au jour un effroyable complot visant à enfanter le Mal incarné.
Un film composé de huit sketches adaptés des fameux contes paillards de Boccace. Les protagonistes sont : un jeune marchand qui aide des voleurs à piller la tombe d'un cardinal, un bûcheron qui tente de se faire engager comme jardinier dans une communauté de religieuses, une femme infidèle qui cherche à dissimuler à son mari la présence de son amant, un libertin qui abuse d'un innocent moine, deux jeunes gens surpris par le père de celle-ci, deux profiteurs ayant peur de l'enfer ainsi qu'un prêtre qui prétend pouvoir transformer une femme en jument.
Le dynamique père Chuck O'Malley prend ses fonctions à la cathédrale Sainte-Marie et devient dans le même temps directeur de l'école paroissiale, tenue par des soeurs sous la ferme houlette de soeur Bénédicte. Surpris par la vétusté des locaux, O'Malley décide qu'il est grand temps de faire construire de nouveaux bâtiments. Il cherche à obtenir des fonds auprès de monsieur Bogardus, un banquier avare et cardiaque. Après une semaine de réflexion, ce dernier accepte enfin d'intervenir en sa faveur. Il annonce à soeur Bénédicte qu'il est prêt à léguer un de ses immeubles à O'Malley. Il lui explique que ce geste fait de lui un autre homme...
Mexique, 1850. L'arrivée d'une jeune fille prénommée Justine, qui vient de perdre ses parents, sème le désordre dans un couvent et déclenche une série d'évènements surnaturels. Elle va faire la connaissance de sa camarade de chambre, Alucarda, une fille réservée, proche de la nature, mais qui cache, sans le savoir, un terrible passé: un lien avec Satan...
Deux vendeurs de friandises travaillant sur des rodéos ont des ennuis avec leur patron. Pour lui échapper, ils montent dans un train roulant vers le Far West. Là-bas, ils se font engager comme cow-boys alors qu'ils ne connaissent rien au métier …
Un meteorite s'ecrase sur la Terre et provoque des mutations irreversibles. Son impact transforme des caniches en drag-queens et dote une cambrioleuse d'une immense langue tueuse.
Des femmes sont enfermées contre leur gré dans un couvent du XIXe siècle, dirigé de main de fer par le prêtre confesseur. Cloîtrées, les recluses supportent mal l'abstinence qui leur est imposée par la mère supérieure. Elles s'abandonnent entre elles au libertinage pour fuir cette autorité.
Rien ne va plus dans une maison de repos depuis que Sœur Gertrude commence à péter un câble. Jusqu’ici, la religieuse bien qu’autoritaire assurait un travail exemplaire auprès du personnel médical. Ayant du mal à se remettre d’une opération chirurgicale, elle a développé une addiction à la morphine qui la mène, petit à petit, à perdre pied.
En 1957, le Père Jonas, prêtre fanatique convaincu d'avoir reçu la mission divine de combattre le sexe, surprend deux adolescents en train de faire l'amour et les assassine. L'Eglise étouffe l'affaire en l'incarcérant. Mais, en 1991, le Père Jonas parvient à échapper à la vigilance d'un jeune prêtre. Le dangereux criminel poursuit alors ses méfaits en piégeant quatre étudiants venus se retrouver dans son ancienne maison diocésaine. Laura et son amant Jeff, Mark qui devait dépuceler Megan, seront tour à tour abominablement masacrés. Seule Megan réussira à s'échapper, croyant laisser pour mort le Père Jonas...