Ο Μπάτμαν είναι αποφασισμένος να πατάξει το έγκλημα και με τη βοήθεια του υπαρχηγού Τζιμ Γκόρντον και του εισαγγελέα, Χάρβεϊ Ντεντ, επιχειρούν να διαλύσουν όσες εγκληματικές οργανώσεις έχουν απομείνει και μαστίζουν την πόλη. Η συνεργασία αποδεικνύεται αποτελεσματική, αλλά σύντομα, θα κληθούν να αντιμετωπίσουν έναν ανερχόμενο εγκληματικό εγκέφαλο, γνωστό στους τρομοκρατημένους κατοίκους της Γκόθαμ, ως Τζόκερ.
Ο Μάρτι ΜακΦλάι είναι ένας φευγάτος νεαρός κι έχει φίλο τον επιστήμονα Έμετ Μπράουν. Χωρίς να το πολυκαταλάβει, μπαίνει στη χρονομηχανή που εφηύρε ο Έμετ και βρίσκεται στην ίδια πόλη 30 χρόνια πριν. Τώρα πρέπει να βρει τρόπο να επιστρέψει χωρίς να χαλάσει το χρονικό συνεχές...
Η πλοκή της ταινίας τοποθετείται χρονικά στο 1995, έντεκα χρόνια μετά τα γεγονότα της πρώτης ταινίας. Ο Τζον Κόνορ, σε ηλικία έντεκα ετών, ζει με τους κηδεμόνες του στο Λος Άντζελες. Η μητέρα του Σάρα Κόνορ, προετοίμαζε τον Τζον ώστε να εκπληρώσει το μελλοντικό του καθήκον. Συνελήφθη ωστόσο, μετά από απόπειρά της να βομβαρδίσει ένα εργοστάσιο με υπολογιστές και στη συνέχεια μεταφέρθηκε σε ψυχιατρική κλινική. Μετά την πρώτη, ανεπιτυχή απόπειρα του υπερυπολογιστή Skynet να εξοντώσει την Σάρα Κόνορ, στέλνει πίσω στο χρόνο έναν νέο, ακόμα πιο εξελιγμένο, σάιμποργκ εξολοθρευτή, τύπου Τ-1000, προκειμένου να εξοντώσει αυτήν τη φορά, τον ίδιο τον Τζον Κόνορ. Παράλληλα, ο μελλοντικός Τζον Κόνορ, στέλνει έναν επαναπρογραμματισμένο εξολοθρευτή τύπου Τ-800, όμοιο με αυτόν που καταδίωκε την Σάρα Κόνορ στην πρώτη ταινία, αυτήν την φορά για να προστατεύσει τον ίδιο (ακόμη σε νεαρή ηλικία) και την μητέρα του.
Ο Μάρτι ΜακΦλάι μόλις επέστρεψε από το παρελθόν κι ο Δρ Έμετ Μπράουν αναγκάζεται να τον στείλει στο μέλλον. Σκοπός του είναι να αποτρέψει τον μελλοντικό του γιο από τα μπει φυλακή. Έτσι, αυτός, ο δόκτορας και η Τζένιφερ ταξιδεύουν στο 2015 όπου τα πράγματα είναι τελείως διαφορετικά από το 1985.
Στο κοντινό μέλλον άνθρωποι και μηχανές βρίσκονται σε διαρκή πόλεμο, μέχρι που το 2029, η νίκη των ανθρώπων είναι σχεδόν βέβαιη, εξαιτίας του ηρωισμού του ηγέτη μιας ομάδας επαναστατών, τον Τζον Κόνορ. Για να αποφύγουν την ήττα οι μηχανές στέλνουν πίσω στο χρόνο έναν εξολοθρευτή για να δολοφονήσει τη μητέρα του Τζον, πριν καν τον γεννήσει.
Ο Μπρους σε μικρή ηλικία βλέπει τη δολοφονία των γονιών του και ορκίζεται να πάρει εκδίκηση. Μεγαλώνοντας ταξιδεύει σε διάφορες χώρες με στόχο να νικήσει τους εσωτερικούς του δαίμονες και να εκπαιδευτεί στην αποκρυπτογράφηση και την αντιμετώπιση εγκληματιών. Όταν επιστρέφει στην πόλη του, την Γκόθαμ Σίτι, αποφασίζει να πολεμήσει το οργανωμένο έγκλημα που αναπτύσσεται ραγδαία. Στο πλευρό του βρίσκονται ο έντιμος αστυνομικός Τζιμ Γκόρντον και η βοηθός εισαγγελέα Ρέιτσελ Ντος. Ο πιστός υπηρέτης του, ο Άλφρεντ, και ο Λούσιος Φοξ, ένας μέτοχος της εταιρείας του, της Wayne Enteprises, τον ωθούν να υιοθετήσει μια μορφή που θα συμβολίζει τη δύναμη του καλού και θα τον βοηθάει να φιλτράρει τον πόνο, το θυμό και τις φοβίες του. Έτσι δημιουργείται το alter-ego του, ο Μπάτμαν.
Ο Μάρτι ΜακΦλάι έχει κολλήσει στο 1955, οπότε και λαμβάνει γράμμα από τον Δρ Μπράουν για το πού είναι η χρονομηχανή. Μια αποκάλυψη, όμως, αναγκάζει τον Μάρτι να πάρει την μηχανή και να σπεύσει προς βοήθεια του καθηγητή. Θα βρεθεί στην παλιά Άγρια Δύση, όπου ο Δρ Μπράουν κινδυνεύει από παρανόμους κι ενώ έχει ερωτευτεί μια δασκάλα.
Οι Μποργκ έχουν επιστρέψει. Ο Κάπτεν Πικάρντ που ηγείται του Εντερπράιζ αποφασίζει να αγνοήσει τις διαταγές της συμμαχίας και να αντιμετωπίσει τους Μποργκ. Με τις γνώσεις που έχει το πλήρωμα καταφέρνει να κερδίσει, αλλά ένας μικρός αριθμός Μποργκ γλιτώνει. Καθώς το Εντερπράιζ τους καταδιώκει, μπαίνει σε μια χρονοδίνη δημιουργημένη από τους Μποργκ. Τώρα βρίσκονται ξαφνικά στον 21ο αιώνα…
Κάθε φορά που το σκοτάδι καλύπτει την Γκόθαμ Σίτι και όπου διαπράττεται έγκλημα, εμφανίζεται ο σκοτεινός εκδικητής Μπάτμαν για να το σταματήσει. Μύθος ή πραγματικότητα; Ο δισεκατομμυριούχος Μπρους Γουέιν δεν κινεί τις υποψίες ότι μπορεί να είναι ο άνθρωπος κλειδί σε όλο αυτό το μυστήριο. Η θέλησή του όμως για εκδίκηση του δολοφόνου των γονιών του σε συνδυασμό με τον έρωτά του για τη δημοσιογράφο Βίκυ Βέιλ θα γίνουν η αιτία για να κινδυνέψει σοβαρά το μυστικό του.
Μια μυστήρια εξωγήινη δύναμη απειλεί τη Γη εξατμίζοντας το νερό των θαλασσών και καταστρέφοντας την ατμόσφαιρα. Για να σώσουν την ανθρωπότητα ο Κάπτεν Κερκ και το πλήρωμα πρέπει να γυρίσουν πίσω στη γη του 1986 για να βρουν το μόνο πλάσμα που μπορεί να σταματήσει το κακό…
Όταν ένας μαγικός μετεωρίτης προσγειώνεται στην Πόλη της Περιπέτειας, τα ατρόμητα κουταβάκια αποκτούν υπερδυνάμεις. Μα μια παλαβή επιστήμονας και ο γνωστός μοχθηρός δήμαρχος έχουν βάλει στο μάτι τις καινούριες τους ικανότητες.
Ο διεφθαρμένος επιχειρηματίας Μαξ Σρεκ συμμαχεί με τον Πιγκουίνο, ένα πανούργο τερατόμορφο πλάσμα για να πάρουν στα χέρια τους τον έλεγχο της Γκόθαμ Σίτι. Για να το πετύχουν αυτό προσπαθούν να πείσουν τους πολίτες να εκλέξουν τον Πιγκουίνο για δήμαρχο, προωθώντας το προφίλ ενός ταλαιπωρημένου και ευαίσθητου πλάσματος. Μαζί τους έχουν την Κάτγουμαν, που δεν είναι άλλη από την γραμματέα του Μαξ, Σελίνα Κάϊλ, η οποία μετά από ένα ατύχημα ξαναγεννιέται διψασμένη για εκδίκηση. Ο Μπάτμαν δεν θα αργήσει να ανακαλύψει το σατανικό αυτό σχέδιο και σύντομα θα πάρει την κατάσταση στα χέρια του.
Δέκα χρόνια έχουν περάσει από τότε που ο Τζον Κόνορ απέτρεψε τη «Μέρα της Κρίσης». Οι μηχανές δεν φαίνεται να μπορούν να τον εντοπίσουν, ως τη στιγμή που, από τα σκοτάδια του μέλλοντος θα ξεπηδήσει η Τ-Χ, η πιο εξελιγμένη φονική Μηχανή. Μοναδική ελπίδα όλων είναι ο Τ-800, ο μυστηριώδης Εξολοθρευτής, που θα αναλάβει να προστατεύσει τον Τζον, ενώ η Εξέγερση των Μηχανών είναι έτοιμη να ξεσπάσει
Η γλυκιά γραφίστρια Πέισενς Φίλιπς δέχεται θανάσιμη επίθεση όταν κατά λάθος ανακαλύπτει μια εταιρική συνωμοσία. Ξεβράζεται σε ένα νησί όπου μια γάτα την ξαναφέρνει στη ζωή και της εμφυσάει τις δυνάμεις της, δίνοντάς της την ευκαιρία να επιστρέψει σαν εκδικητής. Στο κατώφλι της βρίσκεται ο αστυνομικός Τομ Λόουν.
Κατά τη διάρκεια μιας καταδίωξης, ένας αδέξιος φύλακας τραυματίζεται σοβαρά. Με τη βοήθεια της επιστήμης, όμως, θα επιζήσει... για να μεταμορφωθεί σε έναν αστυνομικό εξοπλισμένο με μια σειρά απίστευτων εξαρτημάτων και ταλέντων.