Ο κόσμος έχει πλημμυρίσει από ζόμπι και σε ένα υπόγειο κυβερνητικό καταφύγιο μια ομάδα από επιστήμονες και στρατιωτικούς προσπαθεί να επιβιώσει, ψάχνοντας παράλληλα θεραπεία για να σταματήσει η πανδημία.
Η ιατρική εταιρεία Umbrella Corporation διατηρεί ερευνητικά εργαστήρια κάτω από το έδαφος της Ρακούν Σίτι, όπου καλλιεργείται ένας θανατηφόρος ιός. Κάποιος θα τον κλέψει, ο ιός όμως θα διαρρεύσει μεταμορφώνοντας τους πάντες σε ζόμπι που διψούν για αίμα. Η κυβέρνηση στέλνει μια ελίτ στρατιωτική ομάδα με επικεφαλής την Άλις και τη Ρέιν για να αναχαιτίσουν τον ιό τρεις ώρες πριν μολύνει τον υπόλοιπο κόσμο.
Στο κοντινό μέλλον, έξι μήνες μετά από το σημείο που η πρώτη ταινία μας είχε αφήσει, ο θανατηφόρος ιός έχει πλέον εξοντώσει ολόκληρη τη Βρετανία. Οι αμερικανικές στρατιωτικές δυνάμεις ανακοινώνουν ότι είναι και πάλι ασφαλές να κατοικηθεί η περιοχή κι έτσι ξεκινά ένα κύμα μετανάστευσης προς τη Μεγάλη Βρετανία. Μία οικογένεια θα ενωθεί ξανά, όμως ένα μέλος της κουβαλά ένα τρομερό μυστικό... γιατί ο φρικιαστικός ιός δεν έχει εξοντωθεί τελείως...
Ένας γιατρός μετακομίζει με την οικογένειά του σε κάποια μικρή πόλη των ΗΠΑ που διαθέτει χώρο ταφής για κατοικίδια. Πλάι στο ιδιόρρυθμο αυτό νεκροταφείο βρίσκεται ένας χώρος τελετών των Ινδιάνων Μίκμακ. Ο θρύλος λέει ότι όποιος ταφεί σε εκείνα τα χώματα επιστρέφει ξανά στη ζωή...
Η πράκτορας Άλις, που έχει αποκτήσει υπερφυσικές δυνάμεις ύστερα από βιογενετικά πειράματα που της υποβλήθηκαν, έχει ελάχιστες ώρες μέχρι το ξημέρωμα για να σώσει τους λίγους επιζήσαντες από τον θανατηφόρο ιό που μετατρέπει τους πολίτες της Racoon City σε αιμοδιψή ζόμπι.
Χρόνια μετά την καταστροφή του Raccoon City η Άλις βρίσκεται μόνη της καθώς έχει αντιληφθεί πλήρως ότι θέτει σε κίνδυνο την ζωή οποιουδήποτε βρίσκεται γύρω της. Μόνη της αγωνίζεται να επιβιώσει και να κατατροπώσει την Umbrella Corporation της οποίας ηγείται ο σατανικός Άμπερτ. Στο μεταξύ διασχίζοντας τη Νεβάδα και τα συντρίμμια του Λας Βέγκας, οι νέοι επιζήσαντες πρέπει να αντιμετωπίσουν ορδές από ζόμπι και κοράκια - δολοφόνους καθώς και άλλα τρομακτικά πλάσματα, αποτελέσματα του θανατηφόρου ιού Τ που σκότωσε εκατομμύρια.
Τα μέλη μιας αποστολής σε αναζήτηση για την τελευταία πιστούς της Kito, το κανίβαλος θεό, που βρίσκετε σε ένα μικρό νησί στις Μολούκες Νήσους (Ανατολικές Ινδίες). Είναι σύντομα κυνηγημένα από κανιβάλους και τα ζόμπι που δημιουργήθηκαν από τον σατανικό Γιατρός O'Brien, ο οποίος πειραματίζεται με τα δύο πτώματα και ζωντανούς ανθρώπους. Η Σούζαν, μια σέξι κυρία από ομάδα αποστολή, παίρνει τελικά το πάνω χέρι. Κερδίζει την αποδοχή των ιθαγενείς ως βασίλισσα των κανιβάλων και τα κατευθύνει ενάντια στον τρελό επιστήμονα.
Ένας ιός έχει μετατρέψει κάποιους κατοίκους μιας πόλης των ΗΠΑ σε ζόμπι, ενώ 1,5 εκατομμύριο ακόμα έχουν μολυνθεί, όμως δεν έχουν μετατραπεί, χάρη σε ένα μικροτσιπ που τους έχει χορηγηθεί. Ο δημοσιογράφος Τσέις Κάρτερ γνωρίζει όμως ότι πίσω από αυτό κρύβονται τα θανάσιμα σενάρια συνωμοσίας και εξόντωσης εκ μέρος του στρατού και μια φαρμακευτικής-τεχνολογικής εταιρείας...
Σε ένα απομονωμένο νησί στο Νότιο Ειρηνικό, υπάρχει μια μυστική στρατιωτική εγκατάσταση όπου ο συνταγματάρχης Aiden Wexler ερευνά βιολογικά όπλα. Δέκα χρόνια αργότερα, μια μικρή ομάδα αποστέλλεται στο νησί για να διερευνήσει την κατάσταση της εγκατάστασης. Θα έρθουν σε επαφή με το ελικόπτερο τους οχτώ ώρες αργότερα. διαφορετικά ο τόπος θα βομβαρδιστεί και θα καταστραφεί τελείως. Κατά τη διάρκεια του ταξιδιού τους, επιτίθενται από ζόμπι και όταν καταφέρουν να φτάσουν φτάσουν στο κτίριο, βρίσκουν τον Aiden ζωντανό.