外星人打算侵略地球，他们运用超能力控制了主人公弗莱，并派其去说服人们离开地球前往一个假冒的天堂之地，只留下机器人接管。

　　由《星际宝贝》电影改编的同名《星际宝贝》电视卡通影集，让莉萝和史迪奇开始他们寻找625个太空实验品的旅程。在当初2003年推出第一季《星际宝贝》电视卡通影集推出之前，迪士尼以影音产品首映方式先推出了一部首映作品－《星际宝贝史迪奇》，为整个冒险故事作序；此影集推出后大受欢迎，后来迪士尼继续制作了第二季，并且如同第一季推出时一样，迪士尼也推出了一部影音产品首映《星际宝贝：终极任务》，不过这却是帮整个电视影集系列作结束。本片叙述莉萝和史迪奇完成寻找所有实验品的任务，终於要分离了，史迪奇与强霸和独眼霹雳共同返回外太空，然而没想到这时候又冒出一个新的邪恶实验品勒罗伊，这是邪恶的仓鼠飞轮博士越狱后逼迫强霸新制造的，并复制成一整批勒罗伊军队，准备用它们来统治宇宙，但也因为这事件让莉萝和史迪奇再度重聚，钢图舰长也认识到了自己的错误，决定帮助史迪奇他们。于是，他们携手同心，共同面对这最后的终极任务，粉碎仓鼠飞轮利用实验品展开的阴谋。

　　在美国一个中心城市的科学实验室里，一个粒子的加速装置发生了意外，导致实验室里产生了一个不断扩大的黑洞并且从黑洞中走出一个拥有极大电流的恐怖异种，这一切使得整个地球开始巨烈的震动并开始迅速吞噬着一切，房屋、生命乃至整个地球。一股黑色的恐怖不断蔓延开来。科学家BRYCE和SHANNON开始寻找黑洞产生的原因并找出消灭黑洞及恐怖异种的办法,然而……

宇航员医生 Ivan Hood(Bruce Campbell) 和宇航员Kelly (Renee O'Connor)完成任务回归地球, 他们发现世界被外星人接管了。现在他们必须发动革命，从外星主人手里释放人类奴隶出来。