A film középpontjában olyan apácák állnak, akik a messzi Himalájában, egy hegyi falu hajdani bordélyházából akarják kialakítani a rendházukat. Powell filmjében nem csupán és nem elsősorban a Férfi (akit ez esetben David Farrar alakít a helytartó, Mr. Dean szerepében) a világi kísértés megtestesülése – a Fekete nárciszban tényleg a világ az, amely megkísérti és elbizonytalanítja hivatásukban az apácákat. A férfi és a szex, a házasság lehetősége a világi csábítások és örömök kvintesszenciája. A Fekete nárcisz mégis túlmutat ezeken (igaz, ebben a filmben is találkozhatunk olyan apácával, akit konkrétan Mr. Dean vonzereje kerget az őrületbe) – a buja természet, az egzotikus helyiek, a bordély festményei, az állandóan süvítő szél, olyan hatások, melyek alól a nővérek nem vonhatják ki magukat.

Amelia akkor veszítette el a férjét, amikor az éppen kórházba vitte őt, hogy megszülje első gyereküket. A baleset óta hét év telt el, de a nő még mindig nincs túl rajta, és azóta is egyedül neveli fiát, Samuelt. A srác nem könnyíti meg a dolgát: súlyos viselkedési problémákkal küzd, követelőző és erőszakos, ugyanakkor folyton retteg a szobájában ólálkodó szörnyetegektől. Egy nap talál egy Mr. Babadook nevű, nem hétköznapi gyerekkönyvet, amely hatására a fiú állapota rosszabbodik. Ahogy anya és fia egyre jobban elszigetelődik a külvilágtól, Amelia sejteni kezdi, hogy talán tényleg nincsenek egyedül a házukban.

A II. világháború borzalmaitól megcsömörlött Gian Singh a harcok befejezését követően hazatér az indiai-pakisztáni határ közelében fekvő szülőfalujába, hogy élete hátralévő részét csendes nyugalomban töltse. Ám a sors más szerepet szán neki: Nagy-Britannia 1947-ben leveszi a kezét Indiáról és Pakisztánról, és a két ország között szinte azonnal vallási háború tör ki. Falvak dőlnek romba, családok szakadnak szét, a vidék kegyetlen mészárszék lesz. A harcok közepette Gian talál egy fiatal pakisztáni lányt, akit a védelmébe vesz. A páros hamarosan vonzódni kezd egymáshoz, ártatlanul bimbózó szerelmük elé azonban leküzdhetetlen akadályokat gördít a világ, amelyet gyűlölet ural.

Az Ecuadori dzsungelekben él a Waodani törzs, amely kegyetlenségéről hírhedt. A felnőtt emberek 60 százaléka nem természetes módon hal meg közülük a statisztikák szerint. Az ötvenes évek közepén néhány amerikai misszionárius érkezik családjával a dzsungelbe, hogy kapcsolatot teremtsen a Waodanikkal és a keresztény értékekre, a másik ember iránti tiszteletre, szeretetre és megbocsátásra próbálják őket tanítani. A film igaz történeten alapul.

A fiatal mester, Cao Le mindenképpen el akarja távolítani állapotos feleségét a családi kastélyból, mégpedig azért, mivel meg szeretné menteni őt azoktól a gonosz banditáktól, akik családja meggyilkolására törekszenek.