Tom Cruise tekee komean paluun Ethan Huntin rooliin toimintaseikkailujen sarjan kolmannessa osassa, jonka on ohjannut Lost-sarjan luoja J.J.Abrams. Nyt Hunt joutuu kohtaamaan kaikkien aikojen pahimman vastustajansa, häikäilemättömän asekauppiaan Owen Davianin (Philip Seymour Hoffman). Huima seikkailu kuljettaa pelottoman sankarin tiimeineen Yhdysvalloista Vatikaaniin, Berliiniin ja Shanghaihin.

Piinaava, lähitulevaisuuteen sijoittuva rakkaustarina tapahtuu aikana, jolloin kaupungeissa vallitsee tarkka valvonta ja kaupunkien väliset alueet ovat valtavaa slummiaavikkoa asukkainaan vailla henkilöpapereita olevia ihmisiä. Tutkija William käyttää päivänsä yleensä väärennettyjen papereiden jäljittämiseen, mutta hän rakastuu päätä pahkaa erääseen pääepäillyistään. Williamin on pakko jättää nainen, mutta naisen muisto ei jätä Williamia rauhaan. Epätoivoinen William löytää naisen uudelleen, mutta vain huomatakseen, että naista syytetään Koodi 46:n rikkomisesta.

Lara Croftin elämä on aina täynnä toimintaa, mutta tällä kertaa hänen on kohdattava erittäin vaarallinen tehtävä. Laran on löydettävä muinaisen sivilisaation esine, maailmankaikkeuden pahuuden valtias, Pandoran laatikko, ennen kuin mielipuolinen tiedemies pääsee totettamaan maailmanlaajuista hävitystä. Laran seikkailu alkaa Kreikasta ja jatkuu Hong Kongin kautta Keniaan.