Under en permisjon klarer en småkriminell å flykte fra vaktene sine og dra tilbake til de gamle hjemtraktene for å ta hevn på de som gjorde ham til en følelseskald drapsmann. Jakten på sjelen sin, som han mistet for mange år siden, blir både voldelig og blodig.

Fassbender spiller Callum Lynch, som opplever livet til sin stamfar fra 1400-tallet via en teknologi som låser opp hans genetiske minne. Callum fnner ut at han en gang tilhørte et hemmelig samfunn av snikmordere, og opparbeider seg dødbringende evner for å gå imot de tyranniske tempelridderne.