Amnezija je spasila posada talijanskog ribarskog broda kad pluta na moru. Nema identitet i prošlost, ali posjeduje niz izvanrednih talenata u lingvističkim, borilačkim i samoobrambenim umijećima koji sugeriraju profesiju rizika. Zbunjen i dezorijentiran, on poduzima besnu potragu da otkrije tko je i zašto je njegov život preuzeo tako opasan zaokret.
Prošlost Jason Bournea vraća se po njega. U drugom dijelu sage o tri filma koja se temelji na životu Jason Bournea, bivšeg CIA-inog agenta koji gubi pamćenje i dok se bori da ga oporavi i otkrije tko je on, našao se uključen u mrežu špijunaže i vladine manipulacije od strane Sjedinjenih Država gdje će ga progoniti profesionalni ubojice, paravojni plaćenici i bivši CIA-ini drugovi. Film započinje u Goi u Indiji, gdje su Jason i Marie otišli živjeti da bi se sakrili od Treadstonea, ali tamo ima bivšu tvrtku agent ih locira i progoni. Jason Bourne započinje svoju avanturu da otkrije svoju prošlost sjećanjem se dijela toga i progoni agenta koji se također predstavlja kao on.