يدرك أحد قراصنة الكمبيوتر أن ما يعتبره معظم الناس واقعًا هو في الحقيقة محاكاة يتم إنشاؤها بواسطة آلات، فينضم إلى المتمردين ليتحرر.

يتم استخدام المسرح الصوتي القاحل بشكل أنيق لإنشاء بيئة صغيرة بسيطة تختبئ فيها امرأة غامضة تدعى غريس من المجرمين الذين يلاحقونها. المدينة ذات وجهين وتعرض إيواء غريس طالما أنها تستطيع أن تجعل الأمر يستحق جهدهم ، لذلك تعمل جريس بجد تحت توظيف العديد من سكان المدينة لكسب مصلحتهم. تتصاعد التوترات ، ومع ذلك ، فإن مكانة غريس بصفتها دخيلة لا حول لها ولا قوة تثير الازدراء الشرس والإساءة من مواطني دوجفيل.

تُلقى خطة شرطي شرطة نيويورك جون ماكلين للتصالح مع زوجته المنفصلة عنه في حلقة خطيرة عندما ، بعد دقائق من وصوله إلى مكتبها ، تغلبت مجموعة من الإرهابيين على المبنى بأكمله. مع القليل من المساعدة من شرطة لوس أنجلوس ، ينطلق " ماكلين " المتعثر لإنقاذ الرهائن بمفرده وإنزال الأشرار.

خلال دورة الألعاب الأولمبية في ميونيخ عام 1972 ، تم احتجاز أحد عشر رياضيًا إسرائيليًا كرهائن وقتلهم على يد جماعة إرهابية فلسطينية تُعرف باسم أيلول الأسود. ردا على ذلك ، قامت الحكومة الإسرائيلية بتجنيد مجموعة من عملاء الموساد لتعقب وتنفيذ المسؤولين عن الهجوم.

يصبح (نيو) آخر آمال البشر، فهو الوحيد القادر على فعل المعجزات، ويحاول (نيو) أن ينقذ مدينة زيون التي سوف تقع قريبًا تحت حصار الآلات. يضع الجميع بقيادة (مورفيوس) ثقتهم الكاملة في (نيو)، ويعلقون عليه الآمال بإنهاء الحرب مع الآلات، لا سيما وهم مؤمنون بالنبوءة التي تتوقع نجاحه. يقرر (نيو) وحبيبته (ترينتي) مرافقة (مورفيوس) إلى الماتريكس لمحاولة الوصول إلى قلب النظام عن طريق صانع المفاتيح. في الوقت ذاته ينجو العميل (سميث) من الإلغاء، ويصبح أكثر قوة عن ذي قبل، ويضع نصب عينه هدفًا أساسيًا هو ملاحقة (نيو).

يكتشف نيو (كيانو ريفز) أنه بطريقة ما قادر على استخدام قوته في العالم الحقيقي، وأن عقله باستطاعته التحرر من جسده؛ ولذلك يجد نفسه إذ فجاة محاصرًا في محطة قطار ما بين العالم الحقيقي والماتركس. في أثناء كل هذا تستعد زيون (ريني ناوفاهو) لحرب شعواء ضد الماكينات رغم صعوبة فوز زيون بتلك الحرب. وبين هذا وذاك لا يعلم كلا الطرفين أن هناك طرفًا ثالثًا يسعى للقضاء على العالم كله.

يحصل (الرجل العنكبوت) على مفتاح المدينة نتيجة لجهوده في إنقاذ حياة ابنة العمدة، والمدينة ككل، ونتيجة لذلك يصيبه الغرور، وتتوتر العلاقة بينه وبين حبيبته (مارى جين)، ويواجه بعد ذلك مخلوقًا طفيليًا قادمًا من الفضاء الخارجى لديه القدرة على إضفاء روح عدوانية شريرة.

تحاول ممرضة لطيفة كشف أسرار جِراح مريضتها التي تعيش في غيبوبة، فتُصدم بالخصومة المريرة والخيانة الزوجية والغدر والجريمة وراء كل ذلك.