Už je to chvíle od toho, co se Šindži Ikari probral ve světě o čtrnáct let starším, než ho znal. Nedostává pochopení jak na straně svého otce a jeho společnosti NERVE, tak na straně nově vzniklé organizace WILLE, která se proti NERVE snaží bojovat. A ten jediný člověk, kterému se Šindži dokázal otevřít, zemřel přímo před jeho očima. Nyní se utápí v silné depresi a samotný život pro něj už nic neznamená. Když ale zjistí, že se jeho otec snaží spustit další „dopad“, který zničí lidstvo takové, jaké ho známe, bude se muset sám se sebou vyrovnat a pomoct všem svým starým přátelům.

Píše se rok 2015, 15 let po události, která změnila celý svět - objevení jednoho z andělů. Z obřího Tokya zbyla jen malá pevnost Tokyo - 3, kde sídlí organizace NERV. Právě její vůdce Ikari je ten, který navrhl jedinou účinou zbraň proti andělům - Evangeliony, obrovské roboty. A právě ve chvíli, kdy na město zaútočí další anděl sem přijíždí i Ikariho syn Shinji, který je záhy postaven před nelehkou volbu a nedobrovolně se také stává loutkou na šachovnici mocných, kteří ani nevypadají, že jim jde o záchranu zbytků civilizace.

Příběh chlapce a jeho strýce, který je soukromým detektivem, se odehrává v daleké budoucnosti, kdy vedle sebe žijí lidé a roboti, nikoliv však ve shodě. Mnozí roboti jsou nuceni obývat vyhrazené oblasti a je jim přisouzena úloha pouhých lidských sluhů, což samozřejmě nepřispívá ke klidu ani k harmonickému soužití. Když se chlapec setkává s robotem Timou, dostávají se spolu do mnoha komplikovaných situací, v nichž pochopí, jak důležité jsou city, které lidi odlišují od ostatních bytostí.

Gigantického lidoopa, který na konci snímku Ape vs. Monster (2021) zachránil svět před nebezpečným monstrem, sice zajala armáda, nicméně obavy z jeho ničivé síly i nadále přetrvávají, a proto se tým vědců rozhodne sestrojit zbraň v podobě obří mechanické opice, která má za úkol ono případné nebezpečí odvrátit. Něco se ale pokazí a „robotická příšera“ se namísto ochránce lidstva stává neovladatelnou pohromou...