Filmul este o adaptare a unui roman științifico-fantastic foarte popular în țările Europei de Est („Picnic la margine de drum” de Arkadi și Boris Strugatki) și folosește procedeele specifice genului - din nou un fenomen misterios, poate de origine extraterestră, care ar materializa dorințele cele mai intime ale exploratorilor săi păcătoși - pentru a pune întrebări fundamentale despre umanitate, memorie, dorință și disperare.

Când un monolit negru este descoperit sub suprafața Lunii, devine evident că a fost îngropat intenționat de către o inteligență extraterestră. Curând oamenii de știință îi identifică punctul de origine, planeta Jupiter, iar o echipă de cercetători este trimisă în expediție pentru a o cerceta. Cercetătorul David Bowman descoperă greșeli în sistemul de comunicații al navei expediției și află mai multe decât și-ar fi dorit să știe.

Bărbaţi în Negru, urmăreşte faptele eroice ale agenţilor Kay şi Jay, membri ai unei organizaţii secrete de top, înfiinţată pentru a monitoriza şi a păzii activitatea extraterestră de pe Pămant. Cei doi Bărbați în Negru se trezesc în mijlocul unui complot mortal urzit de către un terorist intergalactic care a sosit pe Pământ pentru a asasina doi ambasadori din galaxii opuse. Pentru a împiedica coliziunea lumilor, MiB trebuie să descopere teroristul și să prevină distrugerea Pământului. Este doar o altă zi obișnuită pentru Bărbații în Negru.

Cândva, în viitor, în Buenos Aires, patru tineri, băieți și fete, se pregătesc să devină ofițeri ai Serviciului Federal. Carmen dorește să devină pilot, Carl vrea să activeze în cadrul secției de consultanță, Rico și Dizzy se pregătesc ca infanteriști. Aceștia din urmă, devin rivali, pentru că amândoi sunt îndrăgostiți de Carmen. Ei nu știu însă că un mare pericol pune în primejdie existența oamenilor pe Pământ: atacul violentelor insecte uriașe de pe planeta Klendathu. Prinși în lupta dură împotriva acestor creaturi, cei patru vor redescoperi că mai presus de orice sentiment e forța prieteniei și solidarității umane.

Când cinci adolescenți descoperă o mașină care îi poate trimite înapoi în timp, posibilitățile par nelimitate. Dar schimbând trecutul, ei amenință viitorul lumii. Pot să anuleze răul dezlănțuit înainte de a fi prea târziu?

Extratereștrii amenință să cucerească în mod violent Pământul, iar un tată înstrăinat trebuie să-și protejeze copiii. Nu se va da în lături de la nimic pentru a-i apăra.

Kay și Jay se reunesc pentru a oferi cea mai bună, ultima și singura linie de apărare împotriva unei seducătoare sinistre, care ridică cea mai dură provocare la necompromisa declaraţie a obiectivelor MIB - protejarea Pământului faţă de nemernicii universului. Au trecut patru ani de când agenții căutători de extratereştrii au evitat un dezastru intergalactic de proporții epice. Acum e o cursă contra cronometru în care Jay trebuie sa-l convinga pe Kay - care nu numai ca nu mai are absolut nici o memorie a timpului petrecut cu MIB, dar este si singura persoană ramasă cu experienţa necesară pentru a salva galaxia, şi să-l reunească cu MIB înainte ca Pământul să cedeze în faţa distrugerii sale finale.

Două creaturi emblematice, provenite din două dintre cele mai înfricoșătoare serii de filme din istorie, se confruntă chiar pe tărâmul nostru în cea mai violentă luptă pe care au purtat-o vreodată.