Pēc tam, kad neizdodas noslēgt svarīgu darījumu, Maiks paliek bez naudas. Tagad viņš ir spiests strādāt nepilna laika slodzes darbu par bārmeni Floridā. Taču kādu dienu viņam rodas iespēja atkal būt uz skatuves.
Rumpelrūķis apmāna pusmūža krīzes skarto Šreku, ļaujot izdzēst viņu no eksistences un nonākot paralēlā laika līnijā, kur valda Rumpelrūķis.
Jautrību mīlošā un jaunā princese Alise ir spiesta trenēties būt perfektai, lai kļūtu patiesi karaliska. Tomēr patiesībā viss, ko viņa vēlas, ir kļūt par pirātu. Viņa ar Lordu Rodžersu, vardi Žanu-Bobu un bruņurupuci Spīdu paceļ buras, lai dotos pārdrošā jūras braucienā. Kad kuģa avārija komandai liek izglābties uz vientuļas un noslēpumainas salas, draugi liek galvas kopā, lai izbēgtu no izsalkušajiem salas iemītniekiem.