بعد التخطيط لتنفيذ إحدى المهام، يرسل (جيم فيليبس) مع زوجته (كلير) وشريكه (إيثان هانت) إلى مدينة (براغ)، وتفشل المهمة ولا ينجو سوى (إيثان هانت)، ويبدأ مدير الوكالة بالشك في (إيثان) بأنه السبب الرئيسي لفشل هذه المهمة، فيحاول إثبات براءته بمختلف الطرق والأساليب الممكنة واكتشاف المتورط الحقيقي.
يتقاعد العميل (إيثان هانت) من عمليات التدريب، لكن يُطلب منه العودة للعمل مرة أخرى لمواجهة تاجر سلاح ومعلومات دولية، يقوم (إيثان) بإعادة لم شمل فريقه بهدف تنفيذ مهمة جديدة، وتتعرض زوجته للخطر أثناء تنفيذ العملية، ويُضطر إيثان لتمديد وقت المهمة بهدف إنقاذ زوجته.
أطلقت الحكومة سراح جون رامبو من السجن للقيام بمهمة سرية للغاية إلى آخر مكان على وجه الأرض يريد العودة إليه - أدغال فيتنام.
تقوم وكالة الاستخبارات الدولية "فايف آيز" بتجنيد عميل "إم آي 6" أورسون فورتشن لمنع بيع تكنولوجيا أسلحة جديدة قاتلة تهدد بتعطيل النظام العالمي.
المارشال الأمريكي سام جيرارد يرافق حمولة طائرة من المدانين من شيكاغو إلى نيويورك. تحطمت الطائرة بشكل مذهل ، وهرب مارك شيريدان. لكن عندما تم تكليف وكيل الأمن الدبلوماسي جون رويس بمساعدة جيرارد على استعادة شيريدان ، يتضح أن شيريدان أكثر من مجرد قاتل آخر.
تدور أحداث القصة حول سرقة فيروس مميت يُدعى (كميرا) والمصل الخاص به، يتعين على العميل (إيثان هانت) منع انتشار الفيروس، والذي يؤدي للوفاة في حالة الإصابة به خلال ساعات معدودة، يكون على إيثان أن يسترجع مصل الفيروس من (شين آمبروز) الذي ينوي بيع المصل المضاد لمجموعة من الإرهابيين للحصول على الأموال الطائلة بعد نشر الفيروس في العالم كله، يستعين إيثان باللصة المحترفة (نياه) لمساعدته في استرجاع المصل والفيروس، إلا أنه سرعان ما يقع في حبها، يسعى إيثان لإنقاذ حبيبته من موت محتم بعد أن تصاب بالفيروس، في الوقت الذي يتوجب عليه إفشال مخطط نشر الفيروس.