სამი წელი გავიდა მას შემდეგ რაც მან უფლის აღთქმის კიდობანი დაიბრუნა. ახლა ჯონსმა დაიბრუნა ექსპონატი, რომელიც მან ბავშვობაში განძის მაძიებლებისგან მოიპოვა: ფრანცისკო დე კორონადოს ჯვარი. ჯონსი შეიტყობს სხვა არტეფაქტის- "წმინდა გრაალის" ისტორიას. ინდიანა გაიგებს, რომ მამამისი ჰენრი ჯონსი, რომელიც წმინდა გრაალს ეძებს, დაიკარგა.
ამ დიდებულ ეპიკურ ფილმში ნეითენ ალგრენი ამერიკელია, რომელიც იაპონელებმა, მე-19 საუკუნის 70-იან წლებში თანამედროვე ომის ხელოვნების სწავლებისთვის დაიქირავეს, რომლის დროსაც ალგრენი სამურაებისგან პატივისცემისა და ღირსების პრინციპებს სწავლობს. მოდერნიზაციისა და თავისუფალი ვაჭრობის დანერგვის მიზნით ალგრენს სამურაების ცხოვრების სტილის მოსპობას აიძულებენ ,მაგრამ ის გადაწყვიტავს თვითონვე გახდეს უკანასკნელი მებრძოლი, და სამურაების გადასარჩენად იბრძოლოს.
მალვაში მყოფი ბორნი კვლავ გამოჰყავს ასპარეზზე ჟურნალისტ საიმონ როსს, რომელიც თავის საგაზეთო სატატიებში ცდილობს ფარდა ახადოს ოპერაცია ბლექბრაიერს, ტრედსტოუნის პროექტის მოდერნიზებულ ვარიანტს. ჟურნალისტისგან მიღებული ინფორმაცია მას მოგონებებს აღუძრავს და იმ დროს, როდესაც კომპანია ცდილობს ბორნის განადგურებას, მისი ბნელი წარსული საბოლოოდ გაცხადდება.