È la storia di Dae-su, imprigionato per 15 anni senza sapere perché, e della sua implacabile vendetta una volta libero. Non dovrà cercare lontano, perché il suo persecutore non ha ancora chiuso la partita. L'appena conosciuta e subito amata Mi-do lo accompagnerà alla ricerca della rivincita e, più ancora, del motivo della sua prigionia.
Fujino, eccessivamente sicuro di sé, e Kyomoto, chiuso in se stesso, non potrebbero essere più diversi, ma l'amore per il disegno manga unisce queste due ragazze di provincia, in una toccante storia di crescita e progresso.
La storia riprende un anno dopo gli accadimenti della serie anime, con i protagonisti che decidono di riunirsi nuovamente per bruciare insieme delle lettere scritte a Menma; con questo sistema infatti i ragazzi intendono far pervenire nell'aldilà i loro messaggi all'amica scomparsa. Il film, oltre a fare un retelling della storia, è un'occasione per approfondire la psicologia dei personaggi e aggiungere nuovi dettagli al racconto.
Ebisuzawa Kurumi, Takeya Yuki, Wakasa Yuri e Naoki Miki frequentano tutti la stessa scuola superiore. Vivono anche nel campus della scuola. Le ragazze si divertono a scuola finché gli studenti non vengono infettati da un virus e si trasformano in zombi. Le ragazze sono circondate da studenti zombi e lottano disperatamente per sopravvivere.
Mikiya Kokutou dà a Shiki Ryougi un gatto da guardare, dato che sarà via per un po'. Anche se Shiki protesta, lui lascia comunque il gatto, e Shiki si ritrova a cercare di capire il suo nuovo compagno felino. Ma per fortuna, il gatto sembra aver preso in simpatia Mikiya e sente la sua mancanza.
Mentre sono sulle tracce della figlia scomparsa di un magnate dell'editoria, il detective Ryu e la sua giovane assistente Kaori si ritrovano su una nave da crociera. Tutto sembra filare liscio fino a quando non salgono a bordo dei sequestratori americani che vogliono chiedere un riscatto per liberare la nave. Riuscirà Ryu a salvare la situazione e a riempirsi lo stomaco?
Nello special troviamo un Lupin in giacchetta nera alle prese con il "Tradimento di Jigen". Jigen infatti sta cercando di far fuori Lupin e Goemon, infuriato, non gli perdona il voltafaccia. Assistiamo a una resa dei conti tra Jigen (considerato "il più temibile rivale di sempre"), Lupin e Goemon.