Η τραγωδία χτυπάει ένα παντρεμένο ζευγάρι καθώς βρίσκονται σε διακοπές στην έρημο του Μαρόκο, ξεκινώντας από μια ιστορία που αγγίζει τέσσερις διαφορετικές οικογένειες.
Ένας ρεπόρτερ μαζί με έναν κάμεραμαν ακολουθούν μία ομάδα άμεσης δράσης μέσα σε ένα σκοτεινό διαμέρισμα και ξαφνικά κλειδώνονται μαζί με κάτι τρομακτικό.
Στη δεκαετία του `70, κι ενώ βομβιστικές επιθέσεις απειλούν τη γερμανική δημοκρατία, μια ομάδα ανταρτών ξεκινά ένοπλη επανάσταση ενάντια στον αμερικανικό ιμπεριαλισμό που υποστηρίζεται από τη γερμανική κυβέρνησή. Η ομάδα έχει στην αρχή στόχο την δημιουργία μιας ανθρώπινης και δίκαης κοινωνίας, στην πορεία όμως γίνεται όλο και πιο απάνθρωπη.
O Ρότζερ Φέρις, ο καλύτερος πράκτορας της Υπηρεσίας Αμερικάνικης Αντικατασκοπίας με ειδίκευση σε αποστολές σε όλη την υφήλιο, αναλαμβάνει να εντοπίσει έναν από τους πιο επικίνδυνους κακοποιούς που βρίσκεται πίσω από μια σειρά βομβιστικών επιθέσεων. Η επιτυχία της αποστολής και η ασφάλεια του Φέρις εξαρτώνται από τη φωνή στην άλλη άκρη της γραμμής ασφαλείας, του βετεράνου της ΣΙΑ, Εντ Χόφμαν, ο οποίος χρησιμοποιεί τα τεχνολογικά μέσα που διαθέτει και καθοδηγεί τον Φέρις στη σύλληψη του τρομοκράτη. Όμως, καθώς ο Φέρις πλησιάζει όλο και πιο κοντά στον στόχο του, ανακαλύπτει ότι η εμπιστοσύνη είναι μια επικίνδυνη πολυτέλεια από την οποία εξαρτάται η ζωή του.
Ο πρακτορας της IMF Ethan Hunt (Tom Cruise) αναλαμβανει, συμφωνα με τη νεα του αποστολη, να βρει και να καταστρεψει ενα φονικο ιο με το ονομα "Χιμαιρα". Ετσι, θα ερθει αντιμετωπος με μια διεθνη ομαδα τρομοκρατων, αρχηγος της οποιας ειναι ενας πρωην πρακτορας της IMF, ο οποιος εχει στα χερια του και το αντιδοτο του ιου που εχει το ονομα "Βελερεφοντης". Στην προσπαθεια του να βρει τους τρομοκρατες ο Ethan Hunt θα συνεργαστει με την Nyah μια ικανη και ομορφη κλεφτρα... Υπο τις οδηγιες του "αφεντικου" του ( Antony Hopkins ) και με τα περιθωρια του χρονου να στενευουν ο Ethan Hunt θα πρεπει να παρει πισω η να καταστρεψει τον ιο πριν αυτος προκαλεσει τον ολεθρο.
Στις 11 Σεπτεμβρίου 2001, η Μητρόπολη της Νέας Υόρκης, ξύπνησε μέσα στον εφιάλτη, όταν κυριευμένα από τρομοκράτες αεροσκάφη, κατέπεσαν, προκαλώντας τον θάνατο εκατοντάδων ανθρώπων, στους δύο ουρανοξύστες του Παγκόσμιου Κέντρου Εμπορίου, γνωστότερους ως Δίδυμους Πύργους. Τα θύματα της τρομοκρατικής επίθεσης θα ήταν σίγουρα πολλαπλάσια, αν δεν εμφανίζονταν γεμάτοι αυταπάρνηση οι αστυνομικοί και οι πυροσβέστες της πόλης, που θυσίασαν την ζωή τους προκειμένου να βγάλουν περισσότερους ανθρώπους σώους από την κόλαση. Ανάμεσα τους υπήρξαν ο αστυνόμος Γουίλ Χιμένο και ο αξιωματικός Τζον ΜακΛάφλιν, που παρέμειναν θαμμένοι κάτω από τα συντρίμμια για πολλές ημέρες περιμένοντας το θαύμα.