Året er 1943, og Mahitos mor omkommer under den amerikanske bombingen av Tokyo. Familien flytter ut til landsbygda, men den 12 år gamle gutten strever med å finne seg til rette på sitt nye hjemsted. En dag dukker det opp en mystisk hegre. Det viser seg at fuglen kan snakke, og den leder Mahito inn i en parallell verden der moren hans fortsatt lever...
En radiovert tar en samtale, der en ukjent person truer med å drepe hele showmannens familie på lufta. For å redde sine kjære, må radioverten spille et overlevelsesspill, og den eneste måten å vinne på er å finne ut identiteten til den kriminelle.