A sikeres Playstation játék, a Final Fantasy VII. történetét folytató filmben két év telt el azóta, hogy Midgar romjai a béke megteremtéséért hozott áldozatok örök mementójaként állnak. A világra azonban hamarosan új veszedelem leselkedik: egy viharos gyorsasággal terjedõ rejtélyes betegség. A régi ellenségek is megélénkülnek, így Cloud, aki megannyi hõstett után visszavonult, és a magányos életet választotta, ismét színre kell hogy lépjen - ezúttal ebben az egész estés filmben!
Lucis varázslatos királyságának ősidők óta birtokában van a mágikus kristály, de Nilfheim fenyegető birodalma kész bármit megtenni, hogy megszerezze azt. A háború emberemlékezet óta tart. Regis, Lucis királya egy elit csapatot jelöl ki, melynek tagjait különleges erővel ruházza fel. Az ő feladatuk a főváros, Insomnia védelme. Eközben a birodalom félelmetes túlerejével ultimátumot igyekszik rákényszeríteni ellenfelére, s győzelmét a trónörökösök házasságával szeretné megpecsételni..