O cientista Seth Brundle (Jeff Goldblum) testa uma máquina de teletransporte de matéria e inadvertidamente permite que uma mosca entre na câmara junto com ele. Quando se dá a reintegração, o DNA de Seth funde com o do inseto, dando início a uma perigosa mutação genética. A transformação é testemunhada pela jornalista Veronica Quaife (Geena Davis).

A família Creed acaba de se mudar da cidade para o campo. A casa é perfeita, mas eles descobrem rapidamente que a estrada diante da casa é percorrida regularmente por camiões a alta velocidade, sem qualquer precaução, e que atrás da casa existe um estranho e sinistro cemitério de animais, onde as crianças da zona enterram os seus amiguinhos, muitos deles atropelados na estrada. Mas pior do que tudo isso é o misterioso lugar que se situa mais atrás, isolado, e onde ninguém vai e de que ninguém fala: um lugar onde os índios sepultavam os seus mortos até que o solo revelou um mal mais tenebroso e mais cruel do que qualquer outro.

O tenente-detective Mike Harrigan (Danny Glover) e a sua força policial declaram guerra aberta a um gang de senhores da droga, na selva urbana de Los Angeles. Mas subitamente, um por um, o gang é liquidado por um misterioso e terrífico adversário, aparentemente com poderes sobrenaturais. Mas quando Harrigan se prepara para levar à justiça esse criminoso desconhecido, apercebe-se que ele e o seu esquadrão já não são os perseguidores: eles tornaram-se o próximo grande jogo do perseguido!

Um navio de luxo no meio do Oceano Pacífico é atacado por uma gigantesca criatura marinha, que mata quase toda a tripulação. Paralelamente, um grupo de homens perigosos se dirige ao mesmo local em uma missão obscura sem saber do ocorrido. Ao chegarem no navio, o barco deles também fica avariado, e agora todos terão que lutar para sobreviver aos poderosos tentáculos do monstro.

De acordo com a teoria da médica Susan McAlester, uma proteína produzida pelo cérebro dos tubarões é capaz de curar os doentes de Alzheimer. Para comprovar a sua hipótese, a médica decide contornar algumas regras éticas e fazer uma manipulação do ADN dos tubarões do centro de investigação aquática. Esta experiência provoca um aumento do cérebro dos tubarões para cinco vezes o seu tamanho original. Quando um dos espécimes foge das instalações marítimas de Aquática e põe em perigo a segurança do estudo, a instituição que financia a pesquisa ameaça retirar-lhe o financiamento. Susan McAlester convida Russell Franklin, um dos responsáveis pela base marítima, para que confirme que está tudo em ordem.

Após um acidente tóxico ter ocorrido próximo de uma pequena cidade do interior dos Estados Unidos, várias aranhas venenosas são expostas à radiação e crescem em proporções monstruosas, ameaçando toda a população local.

Algo estranho aconteceu em uma estação espacial localizada em Marte. A tripulação local entrou em estado de quarentena cinco, antes da comunicação com a Terra ser bruscamente interrompida. Para investigar o caso é enviada uma equipe especialmente treinada para resolver problemas inesperados, que exijam que seus integrantes entrem em ação o mais rápido possível. Só que desta vez eles não tem a menor idéia de qual é o inimigo que precisam enfrentar.

Os sobreviventes do primeiro sharknado se reúnem mais uma vez para combater a uma nova tempestade de tubarões, que agora ameaça Nova York.