אמנדה והחבר הדמיוני שלה, ראדג'ר, מעמידים פנים שהם יוצאים להרפתקאות מסעירות. אבל כשראדג'ר מוצא את עצמו לבד, הוא נאלץ להתמודד עם איום מסתורי.

‏שלושה חסרי בית מוצאים תינוק נטוש בערב חג המולד, יוצאים לחפש את הוריו ונתקלים בשלל טיפוסים מוזרים.

פוניו היא דג זהב קטנה שחיה במעמקי הים. יום אחד היא תופסת "טרמפ" עם מדוזה ועולה אל פני הים, אך נתקעת בתוך צנצנת ריקה שהושלכה למים ונסחפת אל החוף. סוסקה, ילד בן 5, מציל אותה ולוקח אותה איתו בדלי קטן לבית הספר. אביה של פוניו, מכשף ששונא את עולם בני האדם, נחוש בדעתו להחזיר אותה אל מקומה הטבעי ומגייס את כל כוחות הים כדי להשיבה אליו. אבל פוניו כבר הספיקה להתאהב בילד שהציל אותה. יש לה כוחות קסומים משל עצמה, היא החליטה שהיא רוצה להיהפך לילדה אנושית ו להישאר עם סוסקה. פוניו וסוסקה יוצאים להרפתקה שתעמיד במבחן את ידידותם אל מול כוחות הים והיבשה.

קיריטו וחבורתו יוצאים להרפתקה חדשה בעולם חדש ומרתק המכונה: "הסולם הסידורי", עולם משחק חדש העושה שימוש בטכנולוגיית המציאות הרבודה - המייצרת עולם וירטואלי מציאותי בעולם המוחשי. אך עד מהרה, הקו המפריד בין העולם המוחשי למציאות המדומה מתחיל להיטשטש ומציב את גיבורינו בסכנה.

על פי אגדה אורבנית שמתרוצצת לאחרונה בטוקיו, אם תתפרסם בקשה מיוחדת באתר "שאל את הגנב" כנגד אדם מסויים, "גנבי הרפאים של הלבבות" יגנבו את הלב של אותו אדם, יגרמו לו להתחרט על מעשיו ובכך יביאו את הצדק על פשעיו. קאזומה מאקיגאמי הוא גנב בלילות, אבל הוא מתחיל להתחרט על הפשעים שעשה ועל שותפיו לפשע. ​מכיוון שהוא לא מסוגל להתמודד עמם, הוא שולח בקשה ב"שאל את הגנב".

העלילה עוקבת אחרי זוג יתומים השולטים בעיר - פשוט כך. מעיפים כל אחד שלא נראה להם, לא משנה בן כמה הוא, מי הוא, בריון, פושע... כולם בעיר מכירים אותם ואת כוחם הלא מוסבר.

העלילה מתרחשת שבע שנים לאחר שממשלת ארה"ב השמידה את העיר רקון לאחר שהזומבי הראשון יצא החוצה ממעבדות "אמברלה". הסרט עוקב אחר סגירתו של שדה התעופה בעקבות התפרצותו המחודשת של הוירוס בשדה התעופה ומאבקם של הלוחמים בזמומבים על מנת למנוע את התפשטת הווירוס לשאר חלקי ארה"ב.

סרט אנימציה אשר יצא ישירות ל-די-וי-די המורכב מ-6 יצירות קצרות אשר לוקחות מקום בין הסרטים "באטמן מתחיל" ו- "באטמן: האביר האפל". לכל יצירה יש סגנון כתיבה ואנימציה משלה ובכולן מכבב קולו של קווין קונרוי כקולו של באטמן וברוס ווין. הסרט עושה שימוש בסגנון האנימציה היפנית המזכיר את זו שהשתמשו ב"אנימטריקס".

פייט/פרוטוטייפ היא גרסת התקציר של הגרסה המקורית על פי נאסו קינוקו של פייט/סטיי נייט.