Esimene film lõppes vägeva musta võluri Gellert Grindelwaldi (Johnny Depp) vahistamisega MACUSA (Ameerika Ühendriikide võlurikongressi) poolt, tänu Newt Scamanderi (Eddy Redmayne) kaasabile. Kuid nüüd on Grindelwald viinud oma ähvarduse täide ja põgenenud vanglast, et asuda koguma endale järgijaid, kes ei aimagi ta tegelikku plaani: viia läbi puhtavereliste võlurite ülestõus ning asuda kõigi lihtsurelike üle valitsema. Selleks, et Grindelwaldi takistada, palub Albus Dumbledore (Jude Law) abi oma endiselt õpilaselt Newt Scamanderilt. Too annabki nõusoleku, aimamata, millised ohud ees varitsemas on. Üha enam lõhenevas võlurite maailmas kehtestatakse piire ning pannakse proovile ka lähimate sõprade ning pereliikmete ustavussidemed.

Professor Albus Dumbledore teab et vägev must võlur Gellert Grindelwald tahab võlurite maailmas võimu haarata. Kuna ta ei suuda teda üksi peatada, paneb ta magizooloog Newt Scamanderi juhtima võlurite, nõidade ja ühe vapra mugu meeskonda ohtlikul missioonil, kus puututakse kokku nii vanade kui ka uute elukatega ning minnakse vastamisi Grindewaldi jüngrite aina kasvava armeega. Kui aga panused nii kõrged on, siis kui kauaks saab Dumbledore kõrvaltvaatajaks jääda?