Когато 9, се събужда за живот, той открива, че се намира в един свят преминал през апокалипсис. Всички хора са изчезнали и е истинско чудо, че малкият 9 успява да открие малка общност от други като него, търсещи подслон и закрила от ужасяващите машини. Тяхното основно занимание е да бродят по земята и да унищожават тези като Девет. Вместо да бъде новакът, от когото се очаква да бъде смирен и изпълнителен, 9 се оказва лидер на групичката. Той ги убеждава, че криенето нито ще ги спаси, нито ще доведе до нещо по-добро. Сега е моментът за съпротива, само така те ще оцелеят и ще разберат защо машините искат да ги унищожат.

Неочаквана атака на зомбита предизвиква хаос на летището Харвардвил. Леон С. Кенеди и Клеър Редфилд, които разкриха злокобната корпорация Umbrella по време на трагедията в Ракуун, отново са тук. В типичния високооктанов стил на Заразно зло, те са готови за битка със свиреп боец, търсещ отмъщение за избитото си семейство. Смъртоносният G-вирус се разпростира и ново мутирало чудовище вилнее навсякъде. Дали Клеър и Леон ще успеят да унищожат вируса или историята отново ще се повтори?

Годината на действието е 2274-та, а сюжета разказва за жителите на малък град, който се намира под огромен купол. Идилията е налице и от никой от живеещите не се изисква да извършва тежък физически труд. Всички жители са свободни сами да избират с какво да запълват ежедневието си. Но има една уловка. Животът на всички в града е ограничен и когато някой навърши 30 години той бива убит по време на религиозна церемония позната като "Каросел". През годините много са се опитвали да се измъкнат от града, но всички те са били хващани или елиминирани от преследвачите Sandmen. Младият Логан е един от хората, които планират да избягат и по този начин да опазят живота си. След като се запознава с привлекателната Джесика-6 той бива вербуван да се присъедини към тайното общество Sanctuary, което се намира извън границите на затворения град. Задачата на Логан е да сложи край на тази организация, но за да извърши мисията си той трябва първо да се измъкне незабелязано от града.

Анжела Видал и операторът трябва да направят репортаж за това как протича една нощна смяна на пожарникарите в Лос Анджелис. След рутинно обаждане на 911, журналистите отиват на мястото на инцидента. Там вече има полицейски служители, повикани заради смразяващите викове, които се чуват от един от апартаментите. Скоро става ясно, че е един от живущите в кооперацията е инфектиран с непознат вирус. Заразата се разпространява бързо, съседите и екипа се опитват да напуснат сградата, но е твърде късно.