Џејк Гиленхол у улози психотичног адолесцента кога муче визије о смаку света које му најављује огромни, чудовишни зец. Дони Дарко је адолесцент који одраста у дисфункционалној породици. Прича је смештена у мали амерички град у октобру 1988. Једне ноћи, ходајући у сну, Дони наилази на џиновског зеца који му саопштава да ће за мање од месец дана бити смак света. Од тог тренутка, младића муче застрашујуће визије чије значење разуме само он.

Раних 1960-их, два дечака, Игнацио и Енрике, похађају исту католичку школу где откривају љубав, филмове и страх. Отац Маноло, школски управник и професор књижевности активни је сведок тих догађаја. Три лика се поновно сусрећу двапут - касних 1970-их те у 80-има. Ти ће им сусрети у потпуности променити животе.